1. Introduction générale
2. Dynamique démographique des chasseurs-cueilleurs
2.1. Introduction
2.2. Dispersion et évolution des Hommes modernes
2.2.1. Modèles
2.2.2. Dispersions régionales
Dispersion en Asie
Dispersion en Australie
Dispersion en Europe
Dispersion dans les Amériques
2.3. Démographie des chasseurs-cueilleurs
2.3.1. Densités et capacités de soutien
Densité
Capacité de soutien
2.3.2. Croissance démographique
Estimation du taux de croissance
Taux de croissance intrinsèque et taux de croissance net
2.3.3. Commentaire publié de l'article de Read et LeBlanc (2003)
2.3.4. Mobilité et dispersion
Estimations de la mobilité
2.3.5. La « tyrannie » de l'analogie ethnographique
2.4. Conclusion
3. Collecte et description des données environnementales
3.1. Introduction
3.2. Outils et méthodes
3.2.1. Systèmes d'Information Géographique
Données raster et données vectorielles
Utilisation des SIG dans ce travail
3.2.2. Sélection des données
3.2.3. Cartes de friction
3.3. Végétation
3.3.1. Approches cartographiques
Démarche cartographique adoptée
3.3.2. La végétation au dernier maximum glaciaire - article
3.3.3. La végétation présente potentielle
3.3.4. Série temporelle de la végétation européenne
3.3.5. Capacité de soutien de la végétation
3.3.6. Friction de la végétation
3.4. Relief
3.4.1. Données de base
3.4.2. Friction du relief
Pentes
Rugosité
3.5. Hydrographie
3.5.1. Données de base
3.5.2. Capacité de soutien hydrographique
3.5.3. Friction hydrographique
3.6. Environnement côtier
3.6.1. Données de base
3.6.2. Capacité de soutien côtière
3.6.3. Friction côtière
3.7. Conclusion
4. Simulations dynamiques de la démographie historique et de la variabilité génétique des populations humaines
4.1. Introduction
4.2. Modèles décrivant l'évolution démographique des populations
4.2.1. Introduction
4.2.2. Croissance logistique des dèmes
4.2.3. Dispersion, colonisation et migration
4.2.3.1. Modèle linéaire simple
4.2.3.2. Modèle densité-dépendant
4.2.4. Stochasticité démographique
4.3. Le programme FRICTION
4.3.1. Structure générale
Automate cellulaire
4.3.2. Uniformisation des données environnementales
Projection cartographique
Étendue et résolution
Reclassement des grids
4.3.3. Module d'entrées-sorties
4.3.4. Module démographique
4.3.5. Module génétique
Processus de coalescence
Génération de la diversité génétique dans le modèle stepping-stone 2D
Interface
4.3.6. Expansions dans un espace discrétisé
4.3.6.1. Voisinage des cellules
4.3.6.2. Effets des arrondis
4.3.6.3. Effets du choix de la résolution spatiale
4.3.6.4. Effets de bord
4.4. Etude de la diversité moléculaire des populations après une expansion spatiale
4.4.1. Résumé de l'étude
4.4.2. Article
4.5. Simulations sur l'Ancien Monde
4.5.1. Complexifier un monde simple
4.5.2. Variabilité temporelle de la végétation
Utilisation de températures préhistoriques
4.5.3. Identification des côtes
4.5.4. Fluctuations du niveau des océans
4.5.5. Expansions démographiques et spatiales
Milieux désertiques
Calibration des modèles démographiques
4.6. Analyses de sensibilité
4.6.1. Introduction
4.6.2. Implémentation de l'analyse de sensibilité dans FRICTION
4.6.3. Applications des analyses de sensibilité en monde carré uniforme
Paramètres d'entrée
Variables de sortie
Résultats de l'AS par la méthode FAST
Résultats de l'AS par la méthode de Morris
Conclusion de l'application en monde carré
4.6.4. Applications des analyses de sensibilité en monde réaliste
Paramètres d'entrée
Variables de sortie
Résultats de l'AS pour les paramètres environnementaux
AS des variables de végétation
Conclusion de l'application en monde réaliste
4.7. Comparaison des diversités moléculaires obtenues sous des scénarios démographiques et environnementaux distincts
4.7.1. Buts
4.7.2. Méthodes et outils
Détermination des origines de dispersion
Calculs des assignations
Modèles démographiques utilisés
4.7.3. Données génétiques simulées
SNPs
Résultats génétiques et données multilocus
Données multilocus
Résumé complet des étapes de calculs
4.7.4. Résultats et discussions
4.7.4.1. Effets de l'augmentation du nombre de locus
4.7.4.2. Effets de l'hétérozygotie des locus
4.7.4.3. Effet de l'hétérogénéité spatiale et temporelle de l'environnement
Hétérogénéité spatiale de l'environnment
Hétérogénéité temporelle de l'environnement (dynamisme)
Localisations des fausses assignations
4.7.4.4. Assignation régionale
4.7.4.5. Origine unique ou évolution multirégionale?
4.7.5. Implications des résultats
5. Conclusion générale et perspectives
Perspectives
6. Annexes
6.1. Traduction des catégories de végétation
6.2. Cartes de végétation simplifiée et capacités de soutien
6.3. Test pour trouver la projection géographique adéquate
6.4. Programme FRICTION - aspects techniques
6.5. Diffusion classique
6.6. Visualisation des variations démographiques
6.7. Analyses de sensibilité - aspects techniques
6.8. Coordonnées des origines et échantillons
6.9. Programmes CORRELATOR et REGIONS
6.10. Méthodes d'échantillonnage multilocus
6.11. Résultats des études d'assignation
7. Bibliographie
Note(s)