Bengt Kayser entreprend des études de médecine à l’Université d’Amsterdam aux Pays-Bas, qu’il termine en 1986. Après une courte période en clinique, il se lance dans des recherches portant sur les effets de l’altitude sur la performance humaine, au Département de physiologie de l’Université de Genève, et obtient ensuite un doctorat de l’Université libre d’Amsterdam en 1994. Après un postdoctorat de deux ans à l’Université McGill à Montréal, il revient à Genève en 1996. En 2002, il est nommé professeur adjoint à la Faculté de médecine et directeur du nouvel Institut des sciences du mouvement et du sport. Ses intérêts portent sur le rôle du cerveau dans la limitation de l’effort en endurance, la relation entre activité physique et santé et les sciences du sport.