Préambule

Ce document, mis à jour chaque année, contient une liste de laboratoires d'accueil pour les étudiants biochimistes qui doivent effectuer un stage d'un mois dans le cadre de leur 4ème année. Vous trouverez les coordonnées des responsables de laboratoire et une brève description des domaines de recherche proposés. Dans la mesure du possible, nous précisons le nombre de places offertes et leur répartition par période :

• · 1ère période : fin octobre à fin janvier
• · 2ème période : février à fin avril
• · 3ème période : mai à fin juillet

Pour tout renseignement complémentaire, vous êtes priés de contacter Mme Cathy Berthod ou Mme Marie-Line Stucki au secrétariat du Département de biochimie (numéro de téléphone +41 22 379 6487 ou 379 32 36).

Dernière mise à jour en avril 2005

Adresses des départements mentionnés dans ce document:

Préambule
Adresses des départements mentionnés dans ce document:
 
DEPARTEMENT DE BIOCHIMIE
SECTION DE BIOLOGIE
Département de biologie moléculaire - Sciences II
Département de zoologie et biologie animale - Sciences III
CENTRE MEDICAL UNIVERSITAIRE (CMU)
Département de biochimie médicale
Département de physiologie
Département de pathologie
Département de morphologie
Département de pathologie
Département de pharmacologie (APSIC)
Laboratoire de Recherche Louis JEANTET.
Département de pathologie/immunologie, Centre OMS de Vaccinologie
Institut d'histologie et d'embryologie
HÔPITAL
Div. de Biologie de la Croissance et de la Reproduction. Pédiatrie
LABORATOIRE D'HORMONOLOGIE, Maternité.
CLINIQUE DE DERMATOLOGIE
DIVISION D’ENDOCRINOLOGIE ET DIABETOLOGIE
DIVISION des MALADIES OSSEUSES
DIVISION D'IMMUNOLOGIE ET D'ALLERGOLOGIE. 
CLINIQUE DE STERILITE ET D’ENDOCRINOLOGIE GYNECOLOGIQUE 
Laboratoire d'Immunologie des Tumeurs cérébrales  
DIVISION DE NEPHROLOGIE 
LABORATOIRE DES LIPIDES 
DIVISION ENDOCRINOLOGIE ET DIABETOLOGIE 
NEUROPSYCHIATRIE, DEPT DE PSYCHIATRIE 
FONDATION POUR RECHERCHES MÉDICALES 
DIVISION DES MALADIES INFECTIEUSES. 
UNITE DE BIOCHIMIE, Hôpital Belle-Idée 
LABORATOIRE DE BIOLOGIE MOLECULAIRE DES PLANTES SUPERIEURES 
SERONO PHARMACEUTICAL RESEARCH INSTITUTE 
INSTITUT DE BIOCHIMIE Université de Lausanne
ISREC www.isrec.ch
Ecoles Polytechnique fédérales de Lausanne EPFL
INSTITUT PASTEUR

DEPARTEMENT DE BIOCHIMIE

  J. COXJ. COX

022-379.6491

Jos.Cox@unige.ch

Domaine : Recherches sur de nouvelles calciprotéines intracellulaires et leur cible impliquées dans la transduction des signaux cellulaires.

Méthodes: Purification des protéines par les chromatographies conventionnelles et d'affinité, par HPLC. Interactions biophysiques avec le calcium, le zinc, cuivre (flow dialyse, fluorescence, dichroïsme circulaire, réactivité de probes intrinsèques et extrinsèques, etc.). Etudes des domaines fonctionnels. Interactions protéine-protéine et leur modulation par calcium et phosphorylation.

1 stagiaire par période.

U. LAEMMLI

022-379.6122

Ulrich.Laemmli@unige.ch

Domaine: Higher order structure in nuclei and chromosomes.

1 stagiaire par période.

J. GRUENBERG

022-379.6464

Jean.Gruenberg@unige.ch

Domaine : Etudes de la dynamique des membranes intracellulaires dans les voie de l'endocytose et de l'exocytose. Nos efforts portent en particulier sur l'étude des mécanismes contrôlant la biogenèse et l'organisation de compartiments cellulaires, le rôle de domaines membranaires constitués de protéines/lipides spécifiques dans le trafic membranaire, et la fonction de protéines contrôlant adressage et/ou fusion entre membranes.

Méthodes : Utilisation de lignées cellulaires in vitro (culture), et analyse de cellules vivantes (marquage in vivo, transfection). Fractionnement sub-cellulaire. Reconstitution du transport membranaire dans des systèmes acellulaires. Techniques biochimiques (purification et analyse de protéines/lipides), immunologiques (production/purification d'anticorps, immunomarquage, purification par affinité), et moléculaires (PCR, clonage, mutagenèse).

Période de stage à convenir.

H. RIEZMAN

022-379.6469

Howard.Riezman@unige.ch

Domaine : Etudes de la biogenèse des membranes et des organelles dans les cellules eucaryotes ainsi que la signalisation controlant ces processus. Nous nous intéressont aussi aux rôles fonctionnelles des sphingolipides dans les eucaryotes. Nous utilisons la levure, Saccharomyces cerevisiae, comme système modèle.

Méthodes : Des techniques de génétique, génomique, protéomique, et de biologie moléculaire et biochimie de base et de microscopie. Nous reconstituons des étapes de la route de sécrétion en dehors des cellules. Analyse des protéines et des lipides.

SECTION DE BIOLOGIE

Département de biologie moléculaire - Sciences II

S. CITI

022-379.6182

Sandra.Citi@unige.ch

Organisation moléculaire des jonctions étanches et mécanismes de biogenèse de la polarité dans les cellules épithéliales des vertébrés.

1 stagiaire en 2001-2002, période à convenir.

U. SCHIBLER

022-379.6175

ulrich.schibler@molbio.unige.ch

Expression de gènes codant pour des facteurs de transcription impliqués dans les rythmes circadiens.

1 stagiaire en 3ème période.

Département de zoologie et biologie animale - Sciences III

D. DUBOULE

022-379.6771

Denis.Duboule@unige.ch

1 stagiaire. Programme et période à convenir.

B. GALLIOT

022-379.6774/65

Brigitte.Galliot@unige.ch

1) Fonction des gènes à homeobox au cours du développement de l'hydre.

2) Mécanismes moléculaires impliqués dans la régénération de l'hydre.

1 stagiaire, période à convenir.

P. SPIERER

022-379.6799

p.spierer@zoo.unige.ch

a) Clonage et analyse de gènes contrôlant la conformation du chromosome.

b) Contrôle génétique du développement de la mouche Drosophile.

1 stagiaire en 1ère ou en 2ème période.

Département de biologie cellulaire - Sciences III

A. KRÄMER

022-379.6750

angela.kramer@biolcell.unige.ch

a) L'épissage des ARN prémessagers :

b) Caractérisation des interactions entre les protéines, les particules ribonucléoprotéiques et l'ARN pré-messager.

c) Régulation de l'activité des facteurs d'épissage par des modifications post-translationelles.

1 stagiaire, période à convenir.

D. PICARD

022-379.6813

didier.picard@biolcell.unige.ch

Transduction de signal et chaperons molécuaires:

- Transduction du signal hormonal des récepteurs des hormones stéroïdes.

- Activation des récepteurs stéroïdes par des facteurs de croissance.

- Rôle du récepteur pour les oestrogènes pour la progression du cancer du sein.

- Le rôle du complexe de chaperon Hsp90 pour la vie et la transduction de signal.

1 stagiaire, période à convenir.

K. STRUB

022-379.6724

katarina.strub@biolcell.unige.ch

Domaine : Etude de la biologie moléculaire et cellulaire de la SRP (signal recognition particle). Il s'agit d'une particule ribonucléoprotéique qui joue un rôle essentiel dans la localisation correcte des protéines destinées au réticulum endoplasmique. Les mécanismes d'action de la SRP, la formation de la particule, ainsi que ses interactions avec d'autres composants cellulaires sont étudiés en utilisant des systèmes de traduction in vitro, des cellules de mammifères en culture, et la levure.

1 stagiaire, période à convenir.

CENTRE MEDICAL UNIVERSITAIRE (CMU)

Département de biochimie médicale

M. COLLART

022-379.5516

martine.collart@mededine.unige.ch

Domaine: Analyse du mécanisme de régulation de la transcription dans la levure.

Méthodes : Approches génétiques et biochimiques, avec utilisation de techniques de biologie moléculaire.

J.-P. GIACOBINO

022-379.5486

Etude sur les relations entre les métabolismes du tissu adipeux et du muscle et le développement de l'obésité et du diabète. Caractérisation du récepteur b-adrenergique atypique adipocytaire. Souris "knockout" pour le récepteur b3 adrenergique. Modèles in vitro et in vivo: cultures de cellules et souris transgéniques.

1 stagiaire, périodes à convenir.

P. MUZZIN

022-379 5492

patrick.muzzin@medecine.unige.ch

a) Etude de la régulation de la balance énergétique. Rôle physiologique de la protéine découplante UCP3.

b) Mécanisme de résistance à l'action de la leptine.

c) Modèles in vitro et in vivo: cellules transfectées et souris transgéniques.

1 stagiaire, périodes à convenir.

R. OFFORD (Robin.Offord@unige.ch)

O. HARTLEY (olivier.hartley@medecine.unige.ch)

022-379.5740

Divers projets portant sur l'obtention de formes modifiées de protéines à des fins scientifiques ou cliniques. Par ex. : nouveaux analogues anti-HIV des chimiokines.

2 stagiaires, répartition et périodes à convenir.

K. ROSE

022-379.55 23

Rose@cmu.unige.ch

Pas de stagiaire en 2002/2003.

Département de physiologie

A.J. BAERTSCHI

022-705 5347

Alex.Baertschi@unige.ch

Domaine : mécanismes de survie du coeur : canaux ioniques potassiques et hormones cardiaques. Etudes au niveau cellulaire et moléculaire.

Méthode : Utilisation de myocytes cardiaques en culture primaire et de lignées cellulaires. Caractérisation de canaux potassiques ATP-sensibles par patchclamp (cellule entière et canal unitaire), RT-PCR, RNAse protection assay. Reconstitution de canaux dans cellules COS. Sécrétion cardiaques par dosage immunologique et imagerie sur cellule vivante du trafic de des granules de sécrétion. Transfections (microinjection, électroporation) de cDNA codants pour des mutants de prohormones cardiaques.

Période de stage à convenir

Département de pathologie

D. BELIN

022-379.5769

Domaine: le mécanisme de la translocation des protéines dans la lumière du réticulum endoplasmique et dans le périplasme bactérien. Ce phénomène fait intervenir la reconnaissance de séquences peptidiques hydrophobes, les "séquences-signal" par une machinerie membranaire complexe. L'étude in vitro de plusieurs "séquence-signal" naturelles et mutantes, qui sont plus ou moins efficaces, nous permet de disséquer les différentes étapes de la translocation dans des systèmes eucaryotes. Une approche génétique, basée sur la toxicité de protéines chimériques, nous permet de caractériser les gènes codant pour les différents composants du translocon, des protéines qui sont structurellement et fonctionnellement conservées au cours de l'évolution.

1 stagiaire, période à convenir.

Département de morphologie

J.L. CARPENTIER

022-379.5201

J.-P. PACCAUD

022-379.5238

Domaines de recherche:

- biologie du récepteur à l'insuline,

- mécanismes moléculaires du transport intracellulaire du réticulum vers le Golgi.

Techniques : Les projets actuels font usage des techniques de biologie moléculaire, de biochimie, de microscopie électronique et de génétique (levures).

Période de stage à convenir.

Département de pathologie

Ch. CHAPONNIER

022-379.5766

Le laboratoire s'intéresse aux protéines cytosquelettiques telles que l'actine et ses isoformes, les protéines modulatrices de la polymérisation de l'actine et les filaments intermédiaires. On y étudie les variations et modifications de ces protéines dans différents tissus et cellules lors de conditions physiologiques (développement) et pathologiques (plaque athéromateuse, inflammation, cancer). La localisation, la quantification et la régulation de ces protéines sont investiguées par différentes techniques: l'immunofluorescence, la biochimie (purification des antigènes et anticorps, production d'anticorps polyclonaux et monoclonaux, gels mono- et bidimensionnels) et la biologie moléculaire (Southern et Northern blots avec probes spécifiques).

2 stagiaires, période à convenir.

S. IZUI

T. 022-379.7741

Shozo.Izui@unige.ch

Etude d'un modèle spontané d'auto-immunité chez la souris :

a) Analyse génétique des gènes de susceptibilité et de résistance impliqués dans les maladies auto-immunes.

b) Analyse des bases cellulaires et moléculaires du développement de la réponse auto-immune.

c) Analyse de l'activité pathogénique des autoanticorps (anti-immunoglobulines de type facteur rhumatoïde, anti-ADN et anti-érythrocytes).

Techniques utilisées : culture de cellules, dosage d'autoanticorps par ELISA, analyses

cytofluorométriques, PCR, production et purification d'anticorps monoclonaux, génération d'anticorps mutants, transfection.

1 stagiaire, période à convenir

Département de pharmacologie (APSIC)

L. EDER-COLLI

022-379.5448

Eder@cmu.unige.ch

Pas de stagiaire en 2002/2003.

Laboratoire de Recherche Louis JEANTET.

P. HALBAN

022-379.5531

Philippe.Halban@unige.ch

Biosynthèse et transformation de la proinsuline dans les cellules bêta natives, ainsi que dans des cellules non-pancréatiques transfectées avec le gène de l'insuline; études sur molécules d'adhésion des cellules pancréatiques.

2 stagiaires, périodes à convenir.

Institut de biochimie clinique

P.B. IYNEDJIAN

022-379.5551

iynedjian@medecine.unige.ch

Les mécanismes d'action de l'insuline. Régulation de l'expression du gène de la glucokinase hépatique, enzyme-clé du métabolisme des glucides chez les mammifères. Comprendre le mécanisme par lequel l'insuline induit la transcription du gène.

Techniques utilisées : biologie moléculaire et clonage, culture cellulaire et biochimie.

1 stagiaire, période à convenir.

Département de pathologie/immunologie, Centre OMS de Vaccinologie

P.H. LAMBERT

C.A. SIEGRIST

022-379.5778

Sujets : Analyse de la maturation fine de l'avidité des anticorps induits en réponse aux vaccinations : dans des modèles murins d'immunisation et/ou chez l'homme (vaccination des nourrissons, revaccination après greffe de moelle).

Techniques utilisées: Dosage d'anticorps spécifiques par ELISA et ELISA de capture (en conditions « Good Laboratory Practice ») ; caractérisation biochimique des anticorps (profil d'avidité).

Pour stage de diplôme (6 mois) uniquement. 1 personne.

Institut d'histologie et d'embryologie

J.-D. VASSALLI

022-379.5223

Des travaux de stage et de diplôme peuvent être réalisés dans les domaines suivants:

1) Contrôle traductionnel de l'expression des ARN messagers dans l'oocyte de souris.

2) Rôle de la protéolyse extracellulaire dans le système nerveux central ainsi que dans le développement des tumeurs.

3) Embryogenèse de la partie endocrine du pancréas.

Techniques : Les méthodes utilisées comprennent la biologie moléculaire (ADN et ARN), la biochimie des protéines (protéases et leurs inhibiteurs) ainsi que l'embryologie expérimentale (production de souris transgéniques).

1 stagiaire par période.

HÔPITAL

Div. de Biologie de la Croissance et de la Reproduction. Pédiatrie

022-382.4568 Labo. de recherche situé au 3e étage de la

aubert@cmu.unige.ch Fondation pour Recherches Médicales (Tulipe).

Dosage radioimmunologique d'hormone dans le plasma ou dans des extraits d'organes. Utilisation de dosages

d'hormone basés sur la liaison à une préparation de récepteurs (Radioreceptor assay). Diverses petites

techniques chirurgicales sur des rats en vue de prises de sang multiples ou étude de certains paramètres

physiologiques. Pose d'une canule dans le troisième ventricule. Analyse de la distribution des protéines de

liaison pour les facteurs de croissance type IGFs par "Western Ligand Blot". Analyse quantitative de mRNA

d'hormone ou de récepteur d'hormone exprimés dans divers tissus en utilisant un "Nuclease Protection Assay"

ou RT-PCR.

1 stagiaire en 2ème et 1 stagiaire en 3ème période

LABORATOIRE D'HORMONOLOGIE, Maternité.

P. BISCHOF LABORATOIRE D'HORMONOLOGIE, Maternité.

022-382.4336

Nous nous intéressons aux enzymes protéolytiques qui permettent à l'embryon de s'implanter dans l'utérus.

Nous utilisons comme modèles les cellules placentaires issues de produits d'avortement. Pour étudier la

régulation de ces enzymes nous utilisons les méthodes suivantes :

1) Mise en évidence de protéases et d'inhibiteur de protéase dans les cultures de cellules utérine et

placentaire humaines.

2) Dosages radioimmunologiques.

3) Immunohistochimies.

4) Electrophorèse sur gel de polyacryl-amide et immunoblotting.

5) Transfectionn

6) Cat assay.

1 stagiaire par période.

CLINIQUE DE DERMATOLOGIE

L. BORRADORI

022-379.9428/9427

luca.borradori@hcuge.ch

Le projet de recherche consiste en la caractérisation du rôle de la plectine et de l’antigène de la pemphigoïde

bulleuse 230 (BP230) dans l'organisation du cytosquelette dans les tissus musculaires et dans les épithéliums

stratifiés. Des anomalies héréditaires ou acquises de la plectine et/ou de BP230 se traduisent cliniquement par

une fragilité de la peau avec formation de bulles et éventuellement par une dystrophie musculaire.

Le projet bénéficie du soutien du FNSRS, de la Communauté Européenne (V Framework Programme) et de la

Fondation Téléthon Action Suisse.

Techniques : standard de biochimie et de biologie moléculaire/cellulaire (clonage, RT-PCR, mutagénèse,

immunoprécipitation, immunoblotting, immunofluorescence avec double marquage, microscopie confocale,

FACS, transfection cellulaire). Le projet fait essentiellement appel au yeast two-hybrid system pour définir et

caractériser des nouvelles interactions moléculaires.

1-2 stagiaires, Périodes à convenir.

DIVISION D’ENDOCRINOLOGIE ET DIABETOLOGIE

A. CAPPONI

022-379.9362

U. LANG

M. ROSSIER

Domaine : Etude du mode d'action de certaines hormones peptidiques impliquées dans le métabolisme de

l'eau et des électrolytes et le contrôle de la pression artérielle. En particulier, analyse détaillée des mécanismes

de génération du système messager calcique et des processus biochimiques à la base de l'activation des

diverses réponses biologiques de trois types de cellules cibles: la cellule glomérulée du cortex surrénal, la

cellule musculaire lisse vasculaire et le cardiomyocyte. Méthodes utilisées: patch clamp, sondes

intracellulaires fluorescentes et luminescentes, biochimie des kinases et phosphatases, biologie cellulaire et

biochimie de la mitochondrie, biologie moléculaire.

1 stagiaire par période.

DIVISION des MALADIES OSSEUSES

J. CAVERZASIO

T 022-382.9964 Bât. de recherche médicale, 64, av. Roseraie

Fax: 382.9973

Joseph.Caverzasio@unige.ch

Domaine: Mécanismes cellulaires impliqués dans la prolifération et la différenciation des cellules osseuses.

Nous sommes particulièrement intéressés aux signaux de transduction impliqués dans la régulation de la

prolifération et de la différenciation des cellules osseuses, en particulier la synthèse des constituants de la

matrice osseuse et sa calcification. Actuellement, nous étudions les complexes de signalisation impliqués dans

l'activation des voies MAP kinases Erk, JNK et p38 et leur rôle dans le développement des cellules osseuses.

Un modèle de souris knockout pour un gène codant pour une protéine impliquée dans la calcification de la

matrice extracellulaire est également à l'étude.

Méthodes: Culture de cellules osseuses et dosages biochimiques de certains paramètres de différenciation

(phosphatase alcaline, synthèse de collagène, transport de solutés, etc). Analyse de protéines de

signalisation par immunoprécipitation et Western blot. Expression d'ARN messagers par Northern blot, PCR et

analyse d'activités promotrices à l'aide de gènes reporters. Méthodes de biologie moléculaire courantes

(clonage, séquençage, Southern blot).

1 stagiaire, période à convenir.

DIVISION D'IMMUNOLOGIE ET D'ALLERGOLOGIE. 

J.M. DAYER

022-379.9409 Jean-Michel.Dayer@hcuge.ch

D. BURGER

Danielle.Burger@hcuge.ch

022-379.9376

C. CHIZZOLINI

chizzoli@cmu.ch

022-379.9370

Domaine : Mécanismes de l'inflammation - interaction cellulaire (cell-cell contact):

Lors de l'inflammation chronique chez l'homme (p.ex.: arthrite rhumatoïde et sclérose en plaque) les cellules

immunes envahissent le tissu cible et induisent sa destruction. Nos études portent sur le rôle des interactions

cellulaires (facteurs membranaires) et des cytokines et anti-cytokines (facteurs solubles) dans la destruction

tissulaire. Par ailleurs, nos études portent sur des mécanismes qu'utilisent les lymphocytes T pour contrôler le

métabolisme des fibroblastes, surtout dans le contexte de pathologies fibrosantes humaines. Le projet

comprend l'utilisation d'un large éventail de méthodes de biologie cellulaire et moléculaire ayant pour but:

1) L'identification, l'isolation et la caractérisation de facteurs membranaires du lymphocyte T capables d'activer

les cellules environnantes (biologie moléculaire et biochimie).

2) La caractérisation de sous-populations de lymphocytes T (Th1/Th2/alpha bêta double négatifs gamma

delta) exerçant des fonctions biologiques différentes (culture cellulaire et immunologie).

3) La caractérisation des signaux de transductions induits par les lymphocytes T dans les cellules cibles

responsables de la sécrétion de cytokines et de métalloprotéinases (biochimie).

4) La modulation de l’expression de l'activité de surface du lymphocyte T (biologie cellulaire et immunologie).

Bibliographie fournie sur demande.

1 stagiaire, période à convenir. Offre également une place pour un travail de diplôme ou de thèse.

CLINIQUE DE STERILITE ET D’ENDOCRINOLOGIE GYNECOLOGIQUE 

A. DE AGOSTINI

022-382.43.46 Fondation pour Recherches Médicales

Fax: 022-347.5979 64, av. de la Roseraie, 1205 Genève

deagosti@cmu.unige.ch

Protéoglycans et fonction ovarienne.

La rupture du follicule ovarien lors de l'ovulation est sous contrôle hormonal et fait intervenir une protéolyse

contrôlée. Certains protéoglycans, apparentés à l'héparine, lient et activent des inhibiteurs de protéases

comme l'antithrombine III. Les cellules de granulosa produisent ces héparan sulfates et nous étudions leur r& ocirc;le

dans le contrôle des activités protéolytiques dans le follicule ovarien lors de l'ovulation.

Pour étudier le rôle in vivo des héparan sulfate anticoagulants dans la reproduction, nous développons des

souris transgéniques et knockout tissu-spécifiques qui surexpriment ou sont déficientes en ces protéoglycans.

Le stage peut comprendre :

a) la mise en évidence d'héparan sulfates et d'inhibiteurs de protéase dans l'ovaire au niveau des chaines de

glycosaminoglycan, des protéines et des mRNA,

b) la construction de vecteurs d'expression et le test de leur activité par transfection sur des cellules en culture,

c) l'élevage et l'analyse du génotype de souris transgéniques.

1 stagiaire par période. Offre également une place pour un travail de diplôme.

Laboratoire d'Immunologie des Tumeurs cérébrales  

P.-Y. DIETRICH

022-379.9857/62 Division d'Oncologie

Fax: 022-379.98.58

pierre-yves.dietrich@ hcuge.ch

Domaine : Caractérisation de la réponse immunitaire contre les tumeurs

Les axes principaux de recherche sont les suivants :

1) Réponse immunitaire contre les tumeurs cérébrales

Caractérisation phénotypique et fonctionnelle des lymphocytes infiltrant les gliomes ; identification d'antigènes

de gliome ; analyse des mécanismes immunosuppresseurs induits par la tumeur. Développement de modèles

animaux (tumeur implantée par stéréotaxie dans le cerveau, élaboration de souris transgéniques), afin

d’étudier la présentation de l'antigène dans le système nerveux central.

2) Analyse de la réponse immunitaire induite par immunisation chez des patients porteurs de mélanome

Une des difficultés au développement des stratégies vaccinales dans le traitement des cancers est la difficulté

d’analyser avec précision la réponse immunitaire induite. En combinant des approches variées (tétramères,

cytométrie en flux, quantification par anticorps, analyse moléculaire du TCR, ...), nous sommes en mesure de

caractériser la réponse immunitaire induite dans différents compartiments (sang, tumeur, ganglions) et de

suivre cette réponse immunitaire de façon longitudinale. Ce type d'approche permet également d’aborder des

sujets plus fondamentaux, comme la caractérisation de répertoires naïfs contre des antigènes définis.

Pour travail de diplôme exclusivement.

DIVISION DE NEPHROLOGIE 

H. FAVRE

022-379.9767

E. FERAILLE

022-382.3837 Labo. de Néphrologie,

feraille@cmu.unige.ch Fondation pour Recherches Médicales

022-382.3833 64, av. de la Roseraie

Domaine: Les trois axes de recherche du laboratoire sont:

La régulation de la Na,K-ATPase dans les cellules épithéliales du néphron distal

La régulation du volume cellulaire en conditions hypertoniques

La régulation du transport d'eau via l'aquaporine 2 dans les cellules épithéliales du néphron distal

Les techniques utilisées sont:

Culture cellulaire

Mesure de flux ioniques et d'eau

Immunoprécipitation, western blots

RPA et RT-PCR

Mutagenèse dirigée

Transfection et analyse fonctionnelle des cellules transfectées

1 stagiaire, période à convenir. Travail de diplôme de préférence.

LABORATOIRE DES LIPIDES 

R.W. JAMES ,

022.379.9304 - Fx 022-379.9309 Division d’Endocrinologie et Diabétologie

Richard.James@hcuge.ch

Maladies coronariens et diabète: mécanismes pathophysiologiques et protecteurs.

1. Etudes du métabolisme des lipides / lipoprotéines sanguins et les rôles des apolipoprotéines.

2. Stress oxydatif et mécanismes pathophysiologiques.

3. Fontionnement des enzymes anti-oxydants.

Techniques

1. Techniques de base de biochimie (filtration sur gel, PAGE, ultracentrifugation, electrophorèse,

immunoblotting etc)

2. Culture cellulaire.

3. Biologie cellulaire (immunofluorescence).

4. Biologie moléculaire (PCR, transfection, activités promotrices)

Références

- Berliner et al: Circulation, 91, 2488-96 (1995) (Générale)

- Leviev et al: Arterioscler Thromb Vasc Biol 17, 3935-39 (1997)

- Leviev et al: Arterioscler Thromb Vasc Biol 20, 516-521 (2000)

- Deakin et al: J Biol Chem 277, 4301-7 (2002)

1 stagiaire période à convenir.

F. KAREGE DIVISION DE NEUROPSYCHIATRIE

022-305.5314 Labo. de biochimie. Clinique Belle-Idée

FX: 022-305.5309 1225 Chêne-Bourg

1) Mécanisme de Transduction des signaux cellulaires en psychopathologie: Etudes des récepteurs à

monoamines (Noradrénaline, Dopamine, Sérotonine), des Protéines G et des enzymes des seconds

messagers (Adenylate cyclase, phospholipase C etc.),

2) Phosphorylation des protéines, Expression des gènes, Screening génomique et recherche des

polymorphismes en psychopathologie.

1 à 2 stagiaires période à convenir.

K.H. KRAUSE LAB. DE BIOLOGIE DU VIELLISSEMENT, hôpital Belle-Idée

kkrause@cmu.unige.ch Ch. Petit Bel-Air – 1225 Chêne-Bourg

022-305.5450

But : développer un modèle in vitro de l’interaction de la microglie avec des neurones producteurs de

peptides amyloidogènes. Ce modèle permettrait de mieux comprendre certains aspects inflammatoires de la

Maladie d’Alzheimer.

Techniques :

Culture cellulaire : culture primaire de microglie et de neurones.

Biologie moléculaire : transduction à l’aide de vecteurs lentiviraux.

Biologie cellulaire : imagerie et immunofluorescence.

1 stagiaire, période à convenir.

Attila MAJOR DEPT GYNECOLOGIE ET OBSTETRIQUE

attila.major@hcuge.ch

022-382.4231

Sujet : Nouvelles stratégies de traitement du cancer ovarien.

Techniques : travail sur des cultures cellulaires y compris immunologie et nouvelles approches des antigènes

du cancer ovarien.

1 stagiaire, période à convenir.

Danielle MANEN DIVISION des MALADIES OSSEUSES

022-382.9972 Fondation pour la recherche médicale

Fax : 022-382.9973 64, av. De la Roseraie 1205 Genève

manen@cmu.unige.ch

Sujet principal: Etude de l'expression du gène codant pour le récepteur à la parathormone (PTH) dans la

cellule osseuse. Isolation et caratérisation des promoteurs responsables de la synthèse de ce gène.

Techniques: toutes techniques courantes de biologie moléculaire, clonage, PCR, séquençage, northern,

culture de lignées cellulaires, transfection transitoire.

Références :

Manen et al., 1998, Gene 218: 49-56

Manen et al., 2000. J Clin Endocrinol Metab 85:3376-82

1 stagiaire, période à convenir, 1 diplômant.

C.A. MEIER DIVISION d’ENDOCRINOLOGIE ET DIABETOLOGIE

022-379.91.92

christoph.meier@hcuge.ch

Thèmes:

1. Effets directs de la leptine sur les monocytes: signaling intracellulaire, mécanismes d'activation

transcriptionnelle

2. Role des PPARs (peroxisome proliferator-activated receptors) dans les monocytes (actions pro-,

antiinflammatoires, transmigration, expression des cytokines et molécules d'adhésion).

Méthodes:

Culture cellulaire, transfections, gel shift assay, surexpression des protéines (E. coli et in vitro), mutagénèse

dirigée et création de protéines de fusion, sous-clonage, immunofluorescence, FACS, trans-migration, Northern

et Western blotting, RT-PCR quantitative en temps réel

1 stagiaire par période.

J. PHILIPPE DIVISION ENDOCRINOLOGIE ET DIABETOLOGIE

022-379.5567 – 022-379.9302 Labo 7132, CMU

jacques.philippe@hcuge.ch

Thèmes :

1) Etude de la régulation et de l'expression tissulaire des gènes de l'insuline et du glucagon.

2) Développement du pancréas endocrine.

3) Mécanismes physiopathologiques du diabète.

1 stagiaire, période à convenir.

DIVISION ENDOCRINOLOGIE ET DIABETOLOGIE 

F. ROHNER-JEANRENAUD

022-379.9313

F.Rohner-Jeanrenaud@hcuge.ch

Sujet : métabolisme et obésité. Relation entre la leptine, l'insuline, les hormones thyroïdiennes et les

glucocorticoïdes. Etude de leurs impacts respectifs sur différents neuropeptides du système nerveux central

ainsi que sur divers processus métaboliques (métabolisme des lipides et des hydrates de carbone).

Techniques : Injections (ou infusions) intracérébroventriculaires, intraveineuses ou intragastriques. Mesures

d'expression de gènes par Northern blots ou PCR quantitative. Détermination des taux plasmatiques de divers

métabolites et hormones. Mesures d'activité enzymatiques. Technique du clamp

euglycémique-hyperinsulinémique pour évaluer la sensibilité à l'insuline et la captation de glucose in vivo.

Calorimétrie indirecte pour mesurer la thermogenèse.

1 stagiaire, période à convenir.

NEUROPSYCHIATRIE, DEPT DE PSYCHIATRIE 

A. SAVIOZ ,

022-305.5310/5323 Hôpital Belle-Idée

savioz@cmu.unige.ch 2, ch. du Petit Bel-Air, 1225 Chêne-Bourg

Sujet: Etudes de gènes impliqués dans les phénomènes de plasticité neuronale liés à l'âge et aux

démences.

1. Des gènes préférentiellement exprimés chez le malade d'Alzheimer et dans le cortex entorhinal, une des

régions les plus vulnérables à la maladie, ont été isolés par «differential display» et leur expression et fonction

sont analysées chez des modèles de la maladie d'Alzheimer (souris transgénique et lignée neuronale).

2. Dans le cadre d'un travail collaboratif Genève-Vaud (Dr. G. Leuba) deux familles atteintes de démences

atypiques sont caractérisées au niveau neuropathologique et étudiées au niveau génétique.

Méthodes: Biologie moléculaire et cellulaire, hybridation in situ

Pour stage de diplôme uniquement.

FONDATION POUR RECHERCHES MÉDICALES 

W. SCHLEGEL .

022-382.3811 ou 3810 64, av. de la Roseraie - 1211 Genève 4.

Fax: 022-347.59.79

Werner.Schlegel@unige.ch

Domaine de recherche: « Signalling and gene transcription »

Contrôle de la transcription de gènes de réponse précoce par des éléments intragéniques.

Au centre de nos intérêts, c-fos et MKP-1, deux gènes dont la transcription est activée par des mécanismes

qui s'adressent non seulement au promoteur, mais aussi à des éléments de réponse dans des exons et

introns.

Approches: analyses quantitative des RNA (e.g. RT-PCR avec «Taqman»), gènes rapporteurs, mesure

directe de la liaison ADN-facteurs de transcription par techniques optiques: diffraction optique dans le domaine

evanescent (www.biacore.com) ou analyse moléculaire des constantes de diffusion (Zeiss Confocore,

www.zeiss.de/micro).

2 stagiaires; périodes à convenir

DIVISION DES MALADIES INFECTIEUSES. 

P. VAUDAUX

022-372.98.26 - Fax: 022-372.98.30

pierre.vaudaux@hcuge.ch

J. SCHRENZEL

022-372.9337 - f. 022-372.9830

jacques.schrenzel@hcuge.ch

Pathogénèse des infections à staphylocoques dorés:

1) In vitro/in vivo models of S.aureus biofilm.

2) S.aureus molecular determinants of pathogenicity.

3) Bacterial gene expression studies using microarrays and mutagenesis.

1 stagiaire par période.

UNITE DE BIOCHIMIE, Hôpital Belle-Idée 

Jean WIDMER

022-305.5315 Ch. Petit-Bel-Air 2 - 1225 Chêne-Bourg

Domaine : radicaux libres et stress oxydatif; approche physiologique et physiopathologique.

1) Mise au point et dosage par TBARS des lipides peroxydés dans diverses structures (sang, cerveau).

2) Tester l'action des antioxydants naturels et de synthèse sur des modèles de stress oxydant.

3) Mise au point d'une technique de chemiluminescence amplifiée.

4) Application de diverses techniques à la mesure de l'intensité du stress oxydatif en pathologie humaine

(Alzheimer, dépression, schizophrénie) et sur des modèles animaux.

5) Thérapeutique antioxydante en pathologie humaine.

Collaborations possibles avec d'autres laboratoires lémaniques dans le cadre des programmes nationaux.

Collaborations avec le laboratoire central de chimie clinique des HUG.

1 stagiaire (poste disponible), période à convenir, ou 1 diplômant.

AUTRE

LABORATOIRE DE BIOLOGIE MOLECULAIRE DES PLANTES SUPERIEURES 

Prof. W.J. BROUGHTON,

Dr W. DEAKIN .

Dr C. MARIE

1, ch. de l'Impératrice - 1292 CHAMBESY.

Dr X. PERRET

Tél. : 022-906.1740. Fax : 022-906.1741

Dr C. STAEHELIN

Interaction : plantes/microorganismes.

L'interaction symbiotique existant entre les bactéries du genre Rhizobium et des plantes (Légumineuses) se

traduit par la formation de nodules dans lesquels les bactéries fixent l'azote de l'air et le transforment en

ammoniaque. C'est la seule voie par laquelle la plante se procure l'azote nécessaire à son métabolisme. Il

s'agit donc de comprendre les différents mécanismes impliqués dans cette symbiose. A cet égard, notre institut

fait appel à différentes techniques de :

Biologie moléculaire: hybridation, séquençage, mutagénèse, clonage, PCR...

Biochimie: purification de protéines, gels d’acrylamide uni et bidimensionnelle, Western blot, immunodétection.

4 stagiaires, périodes à convenir.

SERONO PHARMACEUTICAL RESEARCH INSTITUTE 

Dr Amanda Proudfoot

amanda.proudfoot@serono.com 14, ch. des Aulx - 1228 Plan-Les-Ouates

Tél. 022-706.96.66 Fax: 022-794.6965

jean-pierre.gotteland@serono.com

L'Institut propose quelques places à des étudiants pour le travail de diplôme, ou pour des étudiants qui ont un

permis valable (pas d'étudiant) qui ont déjà obtenu leur licence ou diplôme. La durée souhaitée de ces stages

est d'une année. L'Institut présente un large éventail d'activités scientifiques pratiquées dans ses

départements spécialisés en:

Biologie moléculaire: - Expression de gènes.

- Clonage de gènes.

Biologie cellulaire: - Immunologie.

- Neurobiologie.

Chimie biologique: - Biochimie.

- Chimie des protéines.

Chimie : - Chimie médicinale.

- Chimie sur support solide.

INSTITUT DE BIOCHIMIE Université de Lausanne

Tél. 021.692.5858

Université de Lausanne

Ch. des Boveresses 155

1066 EPALINGES

ISREC www.isrec.ch

Swiss Institute for Experimental

Cancer Research

Ch. des Boveresses 155

1066 Epalinges

ISREC is a part of an international biomedical research campus that includes the Biochemistry Department of

Lausanne University and a branch of the Ludwig Institute for Cancer Research, providing excellent transgenic-,

peptide-, antibody- and microarray-core facilities.

Postdoctoral, Ph.D. and Diploma positions.

Contact Daniel Constam, tél. +41-21-692.5820 or

daniel.constam@isrec.unil.ch

Ecoles Polytechnique fédérales de Lausanne EPFL

G. VAN DER GOOT

gisou.vandergoot@epfl.ch

Domaine proposé: De nombreuses bactéries pathogènes sécrètent des toxines formatrices de canaux qui sont déterminantes pour leur virulence. Nous nous intéressons aux mécanismes permettant à ces toxines, initialement solubles, de s'insérer dans une membrane lipidique. Nous étudions d'autre part comment ces toxines entraînent la mort des cellules cibles.

Méthodes: fluorescence, électrophorèse, biochimie des protéines, culture cellulaire, immunofluorescence.

Période de stage : à convenir

INSTITUT PASTEUR

Dr Michele GOODHARDT

migood@pasteur.fr Dépt d’immunologie génétique et biochimie

Tél. +33-1.40.61.34.40 du développement

URA CNRS 1960

25, rue du Dr Roux F-75724 PARIS Cédex 15

Stage de 6 à 8 mois. L'étudiant travaillera au sein d'une équipe qui étudie le rôle de la chromatine dans la

recombinaison des gènes des immunoglobulines.

L'équipe offre parfois un poste pour effectuer une thèse. En 2000, le sujet portait sur « role of chromatin

structure in the regulation of immunoglobulin gene rearrangement.