Logiciels UNIGE, HUG, HES-SO
Cette page présente une liste non exhaustive des logiciels produits par les chercheurs d'UNIGE, des HUG et de la HES-SO, pour lesquels un accès peut être obtenu par voie d'une licence non-exclusive.
CARTOOL: un logiciel de cartographie fonctionnelle du cerveau (Ref. 454-A254)
Bénéfices
Ce logiciel est issu du "Functional Brain Mapping Laboratory" de l'Université de Genève. Cartool est un logiciel permettant la visualisation, l'interprétation et l'utilisation d'EEG et d'ERP. Il est puissant et rapide et offre des possibilités de visualisation en 3D. D'autres avantages de Cartool comprennent: (i) la navigation interactive dans de nombreux fichiers EEG, (ii) la visualisation dans des fichiers EEG de manière contextuelle, (iii) le calcul d'ERP semi-automatique, (iv) la visualisation de cartes de potentiel et de voltage des électrodes, (v), la segmentation d'ERP selon leur période de stabilité (aka micro-states), (vi) le travail avec des fichiers d'imagerie en RMN, (vii) la visualisation inverse de solutions en 2D et en 3D, (viii) la possibilité de créer diverses statistiques et analyses de fréquences.
Licences
Ce logiciel est gratuit pour la recherche académique, mais requière une licence d'exploitation formelle pour une utilisation commerciale (conditions). Cartool peut être téléchargé à l'adresse suivante:téléchargement.
Références
Les articles de référence peuvent être consultés à l'adresse suivante:publications.
EDENA: Assembleur pour reads très courts (Ref. 545-A364)
Bénéfices
Ce logiciel issu du laboratoire de recherche en génomique de l'Hôpital Cantonal Universitaire de Genève est un assembleur pour le séquençage d'ADN à haut-débit. Edena se démarque de ses concurrents car il représente les données à assembler par un «graphe des recouvrements». Cette représentation permet une meilleure exploitation des données ainsi qu'une utilisation simplifiée. Le programme permet de produire des génomes bactériens complets d'une très haute fiabilité.
Licences
Ce logiciel est gratuit pour la recherche académique, mais requière une licence d'exploitation formelle pour une utilisation commerciale. Edena peut être téléchargé à l'adresse suivante:conditions.
Références
L'article de référence est: Hernandez D, François P, Farinelli L, Osterås M, Schrenzel J. De novo bacterial genome sequencing: millions of very short reads assembled on a desktop computer,Genome Research. 18:802-809, 2008.
DTC - Estimation du moment du décès (Ref. 742-A620)
Bénéfices
Ce logiciel très complet issu du département de médecine légale de l'Université de Genève fonctionnant sur les navigateurs web (Firefox, Chrome, mais pas Explorer) des PC et smartphones Android, permet de calculer le moment du décès d'une personne. Les algoritmes utilisés se basent entre autres sur les théories reconnues de C. Henssge.
Licences
Les médecins légistes peuvent demander des licences d'exploitation (CHF 350 durée illimitée) en envoyant à Unitec le formulaire suivant:
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Après réception du formulaire, nous vous enverrons une facture. Dès réception du paiement, nous vous transmettrons le logiciel par courrier électronique.
Les conditions d'utilisation sont disponibles en suivant ce lien:
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Références
L'article de référence est: C. Henssge, B. Madea "Estimation of the time since death in the early post-mortem period", Forensic Science International 144 (2004) 167-175.