Recherche sur le COVID-19 à l'UNIGE // UNIGE Research on COVID-19

diagnostic / diagnosis

Professor Habib Zaidi
Associate professor, Department of radiology and medical informatics,  Faculty of medicine, University of Geneva & Chief physicist and Head of the PET Instrumentation & Neuroimaging Laboratory, Geneva University Hospital

Summary

Computed Tomography (CT) has been reported as a clinically relevant approach for the diagnosis and management of COVID-19 patients. A number of studies compared RT-PCR and CT images for COVID-19 diagnosis reporting a performance of CT images in terms of sensitivity and specificity of 94% and 37%, respectively. In this project we aim to build a high specificity Artificial Intelligence-based model to discriminate COVID-19 infections from other lung pathologies.

partner institutions

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Professeure Dagmar M. Haller
Professeure assistante, Santé et Médecine Communautaire, Unité des Internistes Généralistes et Pédiatres,  Faculté de médecine, Université de Genève

résumé

Collaboration avec quatre laboratoires français pour récolter des éléments cliniques en même temps que prélèvement naso pharyngé pour la réalisation d’une RT-PCR. Plus de 1400 situations ont été récoltées, dont environ 20% de positifs.

institutions partenaires

Drs Hubert Maisonneuve et Paul Sebo, UIGP Laboratoires français
Dr Benoit Tudrej (Lyon - France)

Plus d'informations

Tudrej B, Sebo P, Lourdaux J, Cuzin C, Floquet M, Haller DM, Maisonneuve H., "Self-Reported Loss of Smell and Taste in SARS-CoV-2 Patients: Primary Care Data to Guide Future Early Detection Strategies." Journal of General Internal Medicine, 2020 June 9:1–3. DOI: 10.1007/s11606-020-05933-9.

Sebo P, Tudrej B, Lourdaux J, Cuzin C, Floquet M, Haller DM, Maisonneuve H., "Clinical characteristics of SARS-CoV-2 patients: a French cross-sectional study in primary care." Research Square (DOI: 10.21203/rs.3.rs-34635/v1).

 

COVID-19: projets de recherche menés par l'UIGP

 

 

 

 

Professor Nicolas Winssinger
Full professor, Organic chemistry department, University of Geneva

Project partner

Professor Laurent Kaiser
Head, Geneva Centre for Emerging Viral Diseases
Full Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva
Head, Division of Infectious Diseases, University Hospitals of Geneva

summary

The goal is to develop a nucleic acid test to detect a current COVID infection that is simple enough to be done at home by an untrained person. The technology is based on isothermal amplification DNA circuit that do not require specialized equipment with a lateral flow assay readout (akin to pregnancy test).

partner institutions

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Professor Habib Zaidi
Associate professor, Department of radiology and medical informatics,  Faculty of medicine, University of Geneva & Chief physicist and Head of the PET Instrumentation & Neuroimaging Laboratory, Geneva University Hospital

Summary

Annotation of a large amount of CT COVID-19 images requires a huge effort and is a time-consuming process for experienced radiologists. Therefore, manual annotation is impractical within a short period. In this project, we aim to use a large number of normal CT scans to train a deep learning model using deep adversarial networks (GAN) to learn the morphology of normal lung structures and hence to depict potential abnormalities using adversarial approaches.

partner institutions

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Professor Habib Zaidi
Associate professor, Department of radiology and medical informatics,  Faculty of medicine, University of Geneva & Chief physicist and Head of the PET Instrumentation & Neuroimaging Laboratory, Geneva University Hospital

Summary

Recent reports have shown that early and more pronounced findings on CT correlate with the prognosis of COVID-19 patients. Automatic detection and segmentation of infectious lesions from chest CT of COVID-19 patients is challenging owing to heterogeneous nature of infectious lesions. In this project, we aim to develop an auto-encoder-decoder based model to segment whole lungs, different lobes of the lungs and infectious lesions and provide these features to radiologists to aid clinical diagnosis.

partner institutions

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Professor Habib Zaidi
Associate professor, Department of radiology and medical informatics,  Faculty of medicine, University of Geneva & Chief physicist and Head of the PET Instrumentation & Neuroimaging Laboratory, Geneva University Hospital

Summary

In this project, we aim to develop prognostic models using lab data, including radiological scores and quantitative CT imaging features to predict survival in COVID-19 patients. These features will be fed into machine learning algorithms to predict the outcome of patients, including death or recovery. Models performance will be evaluated in terms of sensitivity, specificity, accuracy and area under the curve (AUC) of receiver operating characteristic (ROC) curves.

partner institutions

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Professor Habib Zaidi
Associate professor, Department of radiology and medical informatics,  Faculty of medicine, University of Geneva & Chief physicist and Head of the PET Instrumentation & Neuroimaging Laboratory, Geneva University Hospital

Summary

Chest CT scan is considered a beneficial diagnostic tool for scoring/monitoring of the disease progression or healing. However, potential adverse health effects associated with the radiation exposure from CT scanning restricts multiple examinations of patients. The current study aimed to design an ultra-low dose CT examination setup by using a deep learning approach for Covid-19 diagnosis.  We analyzed more than thousand patient’s images using deep convolutional network and results were analyzed by quantitative and qualitative analysis.

partner institutions

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épidémiologie / epidemiology

Professeure Dagmar M. Haller
Professeure assistante, Santé et Médecine Communautaire, Unité des Internistes Généralistes et Pédiatres,  Faculté de médecine, Université de Genève

résumé

Collaboration avec 25 médecins de famille Français pour récolter des éléments cliniques en consultation et les associer à une suspicion d’infection par le virus

institutions partenaires

Projet coordonné par Dr Hubert Maisonneuve, UIGP en collaboration avec des médecins de famille français

 

Plus d'informations

 COVID-19: projets de recherche menés par l'UIGP

 

 

Professor Olivia Keiser
Assistant Professor, Institude of Global Health, Faculty of Medicine, University of Geneva


Professor Isabella Anne Eckerle
Coordinator, Geneva Centre for Emerging Viral Diseases
Associate Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva
Senior Consultant, Divison of Infectious Diseases, Geneva University Hospitals

summary

The overall aim of this project is to analyze and integrate different data sources (international research findings, national surveillance data, and information from the internet and social media) thereby creating a novel interdisciplinary surveillance system  with the aim of better understanding the transmission of the virus in Switzerland. Our research project combines analyses of traditional surveillance data, fundamental research, phylogenetic analyses and mathematical modelling. Combining the mathematical model with other sub-projects will therefore give us a deeper understanding of the COVID-19 epidemic, and allow us to evaluate the effectiveness of interventions The system will be flexible so that it can be adapted to future outbreaks. All relevant scientific findings from the project will be made available immediately on a dedicated website.

Funding

FNS

partner institutions

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Read FNS full summary

Professeure Isabella Eckerle
Responsable, Centre des maladies virales émergentes
Professeure associée, Département de médecine, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin adjointe agrégée, Service des maladies infectieuses, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeure Claire-Anne Siegrist
Professeure ordinaire, Département de pédiatrie, gynécologie et obstétrique, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin adjointe agrégée, responsable de l'Unité d'immuno-vaccinologie pédiatrique, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeure Caroline Tapparel Vu
Professeure associée, Département de microbiologie et médecine moléculaire, Faculté de médecine, Université de Genève & Département diagnostique - Service de médecine de laboratoire, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeur Laurent Kaiser
Directeur, Centre des maladies virales émergentes
Professeur ordinaire, Département de médecine, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin-chef du Service des maladies infectieuses, Hôpitaux universitaires de Genève

Dre Pauline Vetter
Centre des maladies virales émergentes
Assistante médecine, Département de médecine, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin interne, Service des maladies infectieuses, Hôpitaux universitaires de Genève 

Résumé

Ce projet vise à comprendre les mécanismes d’infection SARS-CoV-2, et notamment :

  • Comprendre les processus d’infection et de propagation du virus au niveau des cellules épithéliales des voies respiratoires supérieures et inférieures et de déterminer le mode de libération du virus pour connaître son degré de transmission;
  • Comprendre l’influence du tabagisme et des maladies chroniques respiratoires sur la réplication du virus;
  • Comprendre au niveau cellulaire, les effets d’une coinfection avec le virus de la grippe;
  • Comprendre le lien entre la charge virale et la gravité de la maladie et comment évolue la réactivité du système immunitaire tout au long de la maladie;
  • Développer des antiviraux contre le SARS-CoV-2.

Financement

Fondation du Groupe Pictet
Fondation Ancrage
Fondation privée des HUG
Fondation privée genevoise

institutions partenaires

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Résumé de la Fondation privée des HUG

Résumé sur le site des HUG

Professeure Dagmar M. Haller
Professeure assistante, Santé et Médecine Communautaire, Unité des Internistes Généralistes et Pédiatres,  Faculté de médecine, Université de Genève

résumé

Dans le cadre de sa collaboration au sein de la Commission des Programmes Sentinella Suisse, l’UIGP a contribué à la mise en place de la surveillance épidémiologique COVID en médecine de famille, pilotée par l’OFSP.

institutions partenaires

Réseau Sentinella : OFSP
Instituts de médecine de famille suisses

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Rapport sur la surveillance des consultations ambulatoires pour COVID-19 

COVID-19: projets de recherche menés par l'UIGP

 

 

 

 

Immunologie et vaccin / Immunology and vaccine

Professor Pierre Cosson
Full professeur, Recombinants antibodies platform,  Faculty of medicine, University of Geneva

Summary

The Antibody core facility has produced and tested a number of antibodies against COVID proteins. These antibodies can be produced and sent to all academic researchers. The rapidly growing list can be found at https://www.unige.ch/medecine/antibodies/

partner institutions

EPFL

Funding

Fondation privée des HUG

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Marchetti A, Hammel P, Lima WC, Zenhausern F, Cosson P., "RB579, RB580, RB581, RB582, RB583, RB584 and RB585 antibodies recognize a  peptide of the SARS-CoV-2 E protein by ELISA" in Antibody Reports (27-05-2020). 

Professor Francesco Luigi Gervasio
Full professor, Pharmaceutical science Section, Faculty of sciences, University of Geneva

Summary

We are using modeling and simulations, validated by biophysical experiments to develop potent and specific peptides targeting the Spike-ACE2 interaction.  These peptides will be tested as is in cells and in animal models and will be further developed as conjugates to stimulate the immune response. 

Partner institutions

University College London, Mount Sinai School of Medicine, DE Shaw Research

Funding

PRACE special call for HPC time and SNF (in preparation)

 

Professeure Claire-Anne Siegrist
Professeure ordinaire, Département de pédiatrie, gynécologie et obstétrique, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin adjointe agrégée, responsable de l'Unité d'immuno-vaccinologie pédiatrique, Hôpitaux universitaires de Genève

Partenaires du projet

Professeure Caroline Tapparel Vu
Professeure associée, Département de microbiologie et médecine moléculaire, Faculté de médecine, Université de Genève & Département diagnostique - Service de médecine de laboratoire, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeure Isabella Anne Eckerle
Responsable, Centre des maladies virales émergentes
Professeure associée, Département de médecine, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin adjointe agrégée, Service des maladies infectieuses, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeur Laurent Kaiser
Directeur, Centre des maladies virales émergentes
Professeur ordinaire, Département de médecine, Faculté de médecine de l'Université de Genève
Médecin-chef du Service des maladies infectieuses, Hôpitaux universitaires de Genève

Résumé

Nous avons lancé mi-mars 2020 le recrutement de patients et de leurs proches. En collectant régulièrement des informations sur leur état de santé et des échantillons biologiques, nous voulons déterminer ce qui constitue une réponse immunitaire protégeant ou aggravant la sévérité du COVID-19.  Nous voulons recruter 50 patients et 200 contacts suivis à intervalles réguliers. Nous mesurerons la quantité de virus dans le corps, leurs réponses immunitaires immédiates (innées) et celles qui s'installent plus tardivement (anticorps, réponses lymphocytaires B et T). Nous nous intéresserons aussi à l'influence positive ou négative de l'immunité existant au moment de l'exposition au virus du COVID-19. Il s’agit de définir ce qui constitue une réponse immunitaire protectrice ou au contraire aggravant la sévérité du COVID-19 afin de guider le développement de vaccins ou de traitements immunomodulateurs à donner à un moment précis de l'évolution de la maladie.

Financement

FNS

institutions partenaires

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Professeure Alicia Sanchez-Mazas
Professeure ordinaire, Unité d’Anthropologie , Département de génétique et évolution, Faculté des sciences, Université de Genève

Résumé

Existe-t-il des différences d’immunité face au coronavirus SARS-CoV-2 entre populations de diverses régions géographiques? Une partie de la réponse est à rechercher dans les génomes de ces groupes de personnes et, plus particulièrement, dans les gènes HLA, responsables du système immunitaire dit adaptatif. Ces gènes ont la particularité de différer souvent entre individus. Des milliers de variants (ou allèles) possibles ont été identifiés et tous ne possèdent pas la même efficacité pour lutter contre un nouveau virus. La fréquence de ces allèles varie d’une population à l’autre du fait des migrations passées et de leur adaptation à divers environnements. Dans une étude à lire dans la revue HLA, des scientifiques de l’Université de Genève (UNIGE), en collaboration avec l’Institut Max Planck de Jéna (Allemagne) et l’Université d’Adélaïde (Australie), identifient les variants HLA potentiellement les plus efficaces contre 7 virus, dont le nouveau coronavirus, et mettent en lumière des variations significatives entre populations.

Plus d'informations

Communiqué de presse "Nous ne sommes pas tous égaux face au coronavirus", 9 juin 2020.

Article publié dans HLA, Binding affinities of 438 HLA proteins to complete proteomes of seven pandemic viruses and distributions of strongest and weakest HLA peptide binders in populations worldwide. Barquera R, Collen E, Di D, Buhler S, Teixeira J, Llamas B, Nunes JM, Sanchez-Mazas A. HLA. 2020 May 31. doi: 10.1111/tan.13956

Professor Gerrit Borchard
Full Professor, Pharmaceutical science section, Faculty of sciences, Universtity of Geneva

Summary

We are developing a formulation for an mRNA vaccine against SARS-CoV-2. This a collaborative project with virologists from Chulalongkorn University, who will perform animal and clinical studies. As a preliminary results, in only two months we have achieved the preparation and characterization of a stable formulation that is showing antigen (spike protein) expression in cell-based assay. The technology will now be transferred to Thailand for successive animal and human clinical studies.

Partner institutions

Chulalongkorn University Hospital, Bangkok, Thailand

Funding

Thai government pending

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Biopharmaceutical Sciences Website

Linkedin posts

 

Professeure Begona Martinez de Tejada
Professeure ordinaire, Département de gynécologie et obstétrique, Faculté de médecine, Université de Genève & médecin-cheffe du service d’obstétrique, Hôpitaux universitaire de Genève

Résumé

L’objectif de ce registre est de répertorier des femmes suspectées d’avoir été infectées par le SARS-CoV 2 pendant leur grossesse. Les conséquences de l'infection par le SARS-CoV 2 durant la grossesse sont incertaines, car les informations épidémiologiques et cliniques manquent jusqu'à présent dans cette population spécifique. Ce registre permet de mettre en place une collecte de données fiables visant à mieux caractériser les risques associés à cette infection chez les femmes enceintes.

institutions partenaires

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Professeur Walter Reith
Full professor, Department of Pathology and Immunology, Faculty of medicine, University of Geneva

PROJECT PARTNERS

Vaccine Formulation Institute

Dr Nicolas Collin, VFI Executive Director

Dr Patrice Dubois, VFI Scientific Director

Summary

This study aims at investigating the immunogenicity of various SARS-Cov-2 candidate vaccines in partnership with the Vaccine Formulation Institute (VFI, Geneva) supported by the Global Health Vaccine Accelerator Programme of the Bill & Melinda Gates Foundation.

The study is performed with four different sub-unit vacines candidates targeting the Receptor-Binding Domain (RBD) of the Coronavirus Spike protein, formulated with several adjuvants developed by VFI, including emulsion-based adjuvants and liposome-based adjuvants.

Neutralizing antibodies responses as well as cellular responses will be analyzed in mice. This will allow to downselect the best adjuvanted vaccine candidates to be included in clinical trials (planned by the end of 2020).

Funding

Vaccine Formulation Institute (VFI)

Bill & Melinda Gates Foundation

partner institutions

National/international, Vaccine Formulation Institute (VFI)

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Press release « Co-development of a GMP emulsion-based adjuvant for human prophylactic vaccines, including COVID-19 vaccines », 27 April 2020.


 

 

 

Professeur Idris Guessous
Professeur associé, Département de santé et médecine communautaires, Faculté de médecine de l’Université de Genève
Médecin-chef de service, Service de médecine de premier recours, Hôpitaux universitaires de Genève

Docteure Silvia Stringhini
Privat-docent, Département de santé et médecine communautaires, Faculté de médecine de l’Université de Genève
Epidémiologue responsable, Service de médecine de premier recours, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeur Didier Pittet
Professeur ordinaire, Département de médecine, Faculté de médecine, Université de Genève & Médecin-chef du Service de prévention et contrôle de l’infection, Hôpitaux universitaires de Genève

Professeur Antoine Flahaut
Professeur ordinaire et Directeur de l’Institut de santé globale, Faculté de médecine, Université de Genève

Résumé

L’étude cherche à préciser quelle proportion de la population a été infectée depuis le début de l’épidémie en Suisse. Une « photographie » indispensable pour une gestion optimale de l’épidémie. Lorsqu’une personne a été infectée par un virus, elle produit des anticorps, que l’on peut retrouver dans son sang. Leur détection contre le coronavirus permet donc de savoir qui a déjà été infecté par le SARS-CoV-2. En effectuant cette analyse sur un échantillon représentatif de la population genevoise, il sera donc possible d’estimer quelle proportion de la population a déjà été infectée par le nouveau coronavirus. Ces informations permettront de comprendre dans quelle phase de l’épidémie nous nous trouvons, d’anticiper les défis à venir et de prendre les mesures adéquates pour lutter contre cette épidémie.

institutions partenaires

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Financement

Office fédéral de la santé publique
Ecole suisse de Santé publique (programme Corona Immunitas)
Fondation de Bienfaisance du Groupe Pictet
Fondation Ancrage
Fondation Privée des HUG
Centre des maladies virales émergentes de la Faculté de médecine de l’UNIGE et des HUG

Plus d'informations

Communiqué de presse "COVID-19: moins de 11% des Genevois infectés" (9 juin 2020)

Article publié dans The Lancet,  DOI: https://doi.org/10.1016/S0140-6736(20)31304-0.

Résumé complet sur le site des HUG

Interview dans le e-journal de l’UNIGE

Professeur Idris Guessous
Professeur associé, Département de santé et médecine communautaires, Faculté de médecine de l’Université de Genève & Médecin-chef de service, Service de médecine de premier recours, Département de médecine de premier recours, Hôpitaux universitaires de Genève

Docteure Silvia Stringhini
Privat Docent, Département de santé et médecine communautaires, Faculté de médecine de l’Université de Genève & Epidémiologue responsable Service de médecine de premier recours, Département de médecine de premier recours, Hôpitaux universitaires de Genève

Résumé

A Genève, certaines personnes ne peuvent se confiner durant la pandémie et sont donc plus susceptibles d’être exposées : personnel soignant ou qui assure le fonctionnement du système des soins; employés des chaînes de grande distribution alimentaire; personnel chargé du service minimum dans les écoles, etc. Dès lors que le déconfinement doit être planifié et les mesures de protection optimisées. Il devient impératif de connaître la proportion de personnes qui ont été infectées et sont immunisées, ainsi que la distribution démographique et géographique. Le projet SEROCoV-WORK consiste à tester la présence d’anticorps IgG anti-SARS-CoV-2, en 3 phases.

  1. employés de trois cliniques/hôpital partenaires (HUG, La Colline, Les Grangettes, L’Hôpital de la Tour)
  2. travailleurs mobilisés non-confinables de trois entreprises de la place
  3. inciter d’autres entreprises genevoises à participer.

institutions partenaires

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En collaboration avec les cliniques privées des Grangettes et de la Colline, l’Hôpital de la Tour,  l’EPFL et la Chambre du commerce, de l'industrie, et des services de Genève

Financement

Fondation privée des HUG

Plus d'informations

Résumé sur le site de la Fondation privée des HUG

Résumé sur le site des HUG

Professor Claire-Anne Siegrist
Full Professor, Department of Paediatrics, Gynaecology and Obstetrics, Faculty of Medicine of the University of Geneva
Senior Consultant, Head of the the Paediatrics Inmmono-vaccinology Unit, Geneva University Hospitals

Professor Arnaud Didierlaurent
Assistant Professor, Department of Pathology and immunology, Faculty of medicine, University of Geneva

summary

The project is a clinical longitudinal study aiming at defining the role of immune responses on disease severity and viral loads in patients and their houshold contacts. It aims to measure the immune response, serology and concentrations of the virus in order to understand the immune response to this pathogen and develop a vaccine. The Center of vaccinology is responsible for profiling the inflammatory  (cytokine, gene expression, innate cell phenotyping), antibody (titers and functional assays) and cellular (plasmablast, B cell memory and CD4/CD8 T cells)responses.  The study is uniquely designed to capture the initial events of the infection, included in those with no symptoms and across age (including pediatric and older adults)

Funding

Fondation privée des HUG
Application for the SNF COVID specific call.

partner institutions

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Professeur Nicolas Mach
Professeur assistant, Département de médecine, Faculté de médecine, Université de Genève & médecin adjoint, Département d'oncologie, Hôpitaux universitaires de Genève
Dr Aurélien Lathuilière
Service d’oncologie et Service de réadaptation, Hôpitaux universitaires de Genève

Partenaires du projet

Professeur Denis Jabaudon
professeur ordinaire, Département des neurosciences fondamentales, Faculté de médecine, Université de Genève

MaxiVAX
Ksenija Pavletic, administratrice
Julien Grogg, directeur des opérations cliniques

Université Laval
Pr Gary Kobinger, Directeur du Centre de Recherche en Infectiologie

Résumé

L’objectif de cette étude est de développer un vaccin contre le Sars-Cov-2 combinant un immunostimulateur puissant et une cible spécifique du coronavirus. La cible est la protéine de surface Spike, administrée sous la forme d’ADN par une injection intradermale alors que le stimulateur du système immunitaire consiste en une capsule produisant un adjuvant puissant implantée sous la peau. Cette technologie d’encapsulation cellulaire fait déjà l’objet d’essais cliniques de Phase II  dans le domaine de l’immunothérapie des cancers. 

institutions partenaires

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Plus d'informations

Communiqué de presse "COVID-19 : Un vaccin genevois contre le SARS-CoV-2 en cours d’étude", 2 juin 2020.

 

 

Microbiologie médicale / Medical Microbiology

Professor Isabella Anne Eckerle
Coordinator, Geneva Centre for Emerging Viral Diseases
Associate Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva
Senior Consultant, Divison of Infectious Diseases, Geneva University Hospitals

Professor Caroline Tapparel Vu
Associate Professor, Department of Microbiology and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva & Diagnostic Department - Department of Laboratory Medicine, Geneva University Hospitals

project partners

Professor Laurent Kaiser
Head, Geneva Centre for Emerging Viral Diseases
Full Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva
Head, Division of Infectious Diseases, University Hospitals of Geneva

Professor Claire-Anne Siegrist
Full Professor, Department of Paediatrics, Gynaecology and Obstetrics, Faculty of Medicine of the University of Geneva
Senior Consultant, Head of the the Paediatrics Inmmono-vaccinology Unit, Geneva University Hospitals

Dr Samuel Cordey
Virology Lab, geneva University Hospitals

summary

Although coronaviruses are known to frequently cross species barriers, we still lack knowledge on the genomic alteration for host adaptation. If metagenomic data are readily available to track the epidemic in real-time, in silico analysis based on sequence data alone cannot sufficiently predict viral phenotypes. Potential changes in the replicative capacity, in receptor affinity, interferon susceptibility or escape from adaptive immune response will have significant impact on public health, treatment or vaccine strategies. Here, we aim to set up a biobank of virus isolates and assess key phenotypic traits of low-passage strains. Our functional data on key traits of evolving virus variants complement viral metagenomic data and can help to guide and adapt immediate response strategies to this pandemic. All SARS-CoV-2 isolates and surrogate viruses will be made available to the research community. With the proposed project, we will be able to centralize and maximize the collaborative output of our Centre necessary to rapidly address this complex and challenging situation.

funding

FNS

partner institutions

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prophylaxie / prophylaxis

Professor Alexandra Calmy
Vice-Dean, Associate Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva
Head of HIV consultation, Division of Infectious Diseases, Geneva University Hospitals

Professor  Niklaus Labhardt
Swiss Tropical and Public Health Institute & Senior Physician at the University Hospital of Basle

Project partners

Thomas Agoritsas, professeur assistant, Département de médecine, Faculté de médecine UNIGE & Médecin adjoint agrégé, Service de médecine interne générale, HUG

Dr Marcel Stöckle, Service d’infectiologie et hygiène hospitalière, Hôpital universitaire de Bâle & Université de Bâle

Dr Dan Lebowitz, Assistant médecin, Département de médecine, Faculté de médecine UNIGE & Chef de clinique, Service de prévention et contrôle de l’infection HUG

Dre Mikaela Smit; Suppléante cheffe de clinique scientifique, Département de médecine, Faculté de médecine UNIGE & Cheffe de clinique scientifique, Service de prévention et contrôle de l’infection HUG

Thomas Perneger, professeur ordinaire, Département de santé et médecine communautaires, Faculté de médecine UNIGE & Médecin-chef du service d’épidémiologie clinique, HUG

Dre Annalisa Marinoscni; Médecin interne, Service des maladies infectieuses, HUG

summary

The availability of simple and effective post-exposure prophylaxis (PEP) to prevent either SARS-CoV-2 infection and/or resulting clinical Coronavirus Disease (COVID-19) will play a crucial role both for the rapid containment and to protect at risk individuals including front-line health care workers now and in future outbreaks. We propose to assess the efficacy, safety and acceptability of same-day Lopinavir/ritonavir-based and Hydroxychloroquine-based PEP compared to standard of care for asymptomatic individuals exposed to individuals diagnosed with SARS-CoV-2 in a category B open-label cluster randomized clinical trial. A simple and effective PEP strategy, that can be prescribed the same day with limited laboratory exams, will help contain both the current pandemic and future COVID-19 outbreaks. Even if effective vaccination and treatment become available, PEP will play an important role in safeguarding individuals at highest risk, including front-line health care workers, and will be crucial for rapid containment of future outbreaks. The PEP candidates we are proposing to investigate are cheap, safe and globally available, including in Switzerland.

Funding

FNS

Fondation privée des HUG

partner institutions

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Professeure Alexandra Calmy
Professeure associée, Département de médecine, Faculté de médecine, Université de Genève & Médecin adjointe - Service des maladies infectieuses, Hôpitaux universitaires de Genève

résumé

Il s’agit du premier essai clinique en Suisse à étudier l'impact de deux thérapies prophylactiques contre le COVID-19. Il teste l'efficacité de l'hydroxychloroquine et du lopinavir/ritonavir, chez des personnes exemptes de tout symptôme, mais ayant été en contact étroit avec des patient·es récemment diagnostiqué·es positif·ves au COVID-19. L'étude, débutée le 23 avril, inclura environ 400 participants et durera quatre à six mois.

institutions partenaires

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Hôpital universitaire de Bâle
Institut Tropical et de Santé Publique Suisse et des autorités de santé publique de Genève et de Bâle

Financement

Edmond de Rothschild
Union Bancaire Privée
Fondation pour la Recherche et le Traitement Médical
Fondation privée des Hôpitaux universitaires de Genève

Plus d'informations

Résumé complet de la recherche sur le site des HUG

 

 

traitements / treatments

Professeur François Mach
Professeur ordinaire, Département de médecine, Université de Genève & médecin chef du service de cardiologie, Hôpitaux universitaires de Genève

Dre Elena Tessitore
Service de cardiologie, Hôpitaux universitaires de Genève

Résumé

Ce projet vise à analyser les effets du virus SARS-CoV-2 et des stratégies médicamenteuses sur le système cardiovasculaire. Il est construit en deux phases. La première durant laquelle sont analysés le parcours de soins et les traitements administrés aux patients hospitalisés pour Covid-19. Et une seconde qui s’étendra jusqu’à un an après la fin de l’hospitalisation et durant laquelle seront compilés les événements cardiovasculaires nouveaux, les changements de traitements et l’impact de la maladie sur la qualité de vie.

institutions partenaires

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financement

Fondation privée des HUG

 

 

 

 

Professor Nicolas Demaurex
Full professor, Départment of cell physiology and metabolism, University of Geneva

summary

Assessing the proton and calcium channel function of the SARS-CoV-2 E protein to develop new screens for antiviral compounds. Manipulating the pH of the ERGIC and of endosomes to disrupt the SARS-CoV-2 virus cycle.

project partners

Professor Caroline Tapparel Vu
Associate Professor, Department of Microbiology and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva

Professor Karl-Heinz Krause
Full professor, Department of pathology and immunology, University of Geneva

Professor Sergio Grinstein
Senior scientist in the The Hospital for Sick Children Research Institute and a professor of Biochemistry at the University of Toronto

Professor Dr Barbara Niemeyer
Full professor, Saarland University, Germany

Funding

Project submitted to the Gertrude Von Meissner fondation. Submission to the PNR Covid-19 of the SNF planned.

 

 

Vincent Jaquet
Senior lecturer, Department of pathology & immunology, Faculty of medicine, University of Geneva

Project partner

Professor Jean-Luc Wolfender
Full professor, Pharmaceutical sciences section, Faculty of sciences, University of Geneva

summary

Identification of drugs interfering with the hast translational inhibitor nspl of SARS-CoV2 by high throughput screening.

Funding

Submitted to SNF

 

 

 

Professor Nicolas Winssinger
Full professor, Organic chemistry department, University of Geneva

Project partner

Professor Nicolas Vuilleumier
Associate professor, Department of medicine, University of Geneva &
University Hospitals of Geneva

summary

How diverse is the antibody response to COVID across different patients? Is there epitopes that are more protective than others? Can this be correlated to the severity of symptoms? The first step in answering these questions is to map the epitopes of the antibody response to COVID19 which is performed with a peptide microarray.

partner institutions

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Professeur Walid Habre
Professeur ordinaire, Département d’anesthésiologie, pharmacologie et soins intensifs, Faculté de médecine, Université de Genève & Service d'anesthésiologie, Département de médecine aiguë, Hôpitaux universitaires de Genève
Dr André Dos Santos Rocha
MD-PhD, Département d’anesthésiologie, pharmacologie et soins intensifs, Faculté de médecine, Université de Genève

Résumé

L’étude porte sur les effets potentiellement bénéfiques du positionnement ventral des patients atteints de pathologie pulmonaire au COVID-19, sur l'aération pulmonaire et l’harmonisation entre la ventilation et la perfusion du poumon lors de la ventilation mécanique. L’équipe de recherche émet l’hypothèse que la position ventrale améliorerait la distribution de l’air et la circulation au niveau pulmonaire. Ces effets, connus pour d’autres maladies pulmonaires, restent à démontrer pour la maladie à COVID-19.

institutions partenaires

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financement

 Unité d’investigations anesthésiologiques - HUG

 

 

Dr Frédéric Lador
Privat Docent, Département de médecine, Faculté de médecine, Université de Genève & médecin adjoint, Service de pneumologie, Hôpitaux universitaires de Genève

Résumé

Les processus impliqués dans le COVID-19 restent à découvrir. Des atteintes du parenchyme pulmonaire, vasculaire par une micro-angiopathie et musculaire par les conséquences de l’inflammation pourraient expliquer la persistance de symptômes à distance de l’infection. Notre objectif est de mieux comprendre l’implication de ces différents processus par une exploration physiologique et radiologique. Un accent sera aussi porté sur les conséquences de ces atteintes sur la qualité de vie et l’intérêt d’une réhabilitation pulmonaire ambulatoire.

institutions partenaires

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Professor Chantal Csajka
Full professor, Pharmaceutical sciences section, Faculty of sciences

Summary

Retrospective analysis of the frequency of use of preventive and therapeutic practices, and their associations with occurrence of respiratory infections, Covid-19, and disease outcomes based on a international survey.

 

Project Partners

Dr Bertrand Graz, Antenna Foundation (CH)
Dr Houriet, University of North Carolina, Greensboro, US

Professor Ramesh PILLAI
Full professor, Department of Molecular Biology, Faculty of sciences, University of Geneva

Project partners

Professor Volker Thiel
Institute of Virology and Immunology, University of Bern
Professor Sebastian Leidel
Department of Chemistry and Biochemistry, University of Bern.
Professor Martin Beer, Institute of Diagnostic Virology (IVD), Friedrich Loeffler Institut, Reims, Germany
Professor Klaus Osterrieder, Institute of Virology, Freie Universitat Berlin, Germany

summary

We hope to discover RNA modifications that are installed by host enzymes on the SARS-COVID-2 genomic RNA. Viruses use host RNA modification machinery to camouflague themselves from host innate immune system. Reverse engineered viruses carrying mutations in these sites will be created for vaccine development.

 Funding

SNF Coronavirus Call grant submitted

 

 

Professor Bernhard Wehrle-Haller
Department of cell physiology and metabolism, Faculty of medicine, University of Geneva

Project partners

Philippe Le Mercier
Swiss Institute of Bioinformatics

Professor Vesa Hytönen
Associate professor, Faculty of Medicine and Health Technology, Tampere University, Finland

summary

Analysing whether receptors of the integrin family are used by the virus for infection, either alone or in combination with ACE2. Establish whether already clinically approved integrin drugs would reduce virus infection

 

Professor Leonardo Scapozza
Full professor, Pharmaceutical sciences Section, Faculty of sciences, University of Geneva

Summary

To cure the viral infection and prevent the spreading of the SARS-CoV-2, inhibiting its main protease is a viable strategy. The SARS-CoV-2 main protease is essential for proteolytic processing of viral polyproteins, and its inhibition constitutes a conventional therapeutic strategy.
The aims of this proposal that uses NMR combined with molecular modelling as the screening tools are to:
1. Repurpose approved drugs against the main protease of SARS-CoV-2
2. Provide structure-activity relationship insights to the medicinal chemistry community to quickly improve existing drugs
3. Explore allosteric binding sites
Besides the immediate benefit toward the discovery of a cure against SARS-CoV-2, the expected outcome should immediately fuel medicinal chemistry for an efficient response to the pandemic.

 

Project partners

Dr. Julien Orts, Department of Chemistry and Applied Biosc., Laboratory of Physical Chemistry, ETH Zurich

Funding

Proposal submitted to SNF NRP_COVID19

 

Professor Caroline Tapparel Vu
Associate Professor, Department of Microbiology and Molecular Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva

Professor Francesco Stellacci
Full professor, Supramolecular Nanomaterials and Interfaces Laboratory, EPFL

project Partners

Professor Isabella Anne Eckerle
Coordinator, Geneva Centre for Emerging Viral Diseases
Associate Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva
Senior Consultant, Divison of Infectious Diseases, Geneva University Hospitals

Professor Bruno Correia
Assistant professor, Laboratory of Protein Design & Immunoengineering, EPFL

summary

Testing the activity of nano material based antivirals mimicking widely used viral attachment receptors (heparan sulfate and sialic acid) against SARS-CoVs and the other coronaviruses. Developing new antivirals to fight COVID19. Testing antivirals targeting cellular pathways hijacked by the virus.

Partner institutions

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EPFL

Funding

Fondation privée des HUG
Fondation CARIGEST
SNF

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droit / law

Professeur Christian Bovet
Professeur ordinaire, Département de droit public, Faculté de droit, Université de Genève

Valentine Delaloye
Assistante, Département de droit public, Faculté de droit, Université de Genève

Jeremy Bacharach
Assistant, Faculté de droit, Université de Genève


Plus d'informations

 

Professeur Frédéric Bernard
Professeur ordinaire, Faculté de droit, Université de Genève

résumé

L’apparition du nouveau coronavirus en début d’année a pris de court les Etats par la rapidité de sa propagation et les risques de débordement de leurs systèmes de santé. Depuis 2012, la Suisse dispose d’une nouvelle loi fédérale sur les épidémies, qui a précisément été conçue pour réagir à l’apparition de nouvelles maladies transmissibles. La présente contribution propose une première analyse de l’application de cette loi dans la lutte contre le nouveau coronavirus ; ce faisant, elle s’interroge sur la mise en oeuvre du renforcement de la responsabilisation individuelle et du désenchevêtrement des compétences entre la Confédération et les cantons.

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Sciences politiques et sociales / political and social sciences

Professeur Bernard Debarbieux
Professeur ordinaire, Faculté des sciences de la société, Université de Genève

Résumé

On a vu déferler, peu après le virus lui-même, des termes participant d’un ensemble de mesures préventives, à valeur normative donc, aussi surprenants les uns que les autres ; plus intéressant encore, ce vocabulaire a été adopté sans réserve par les médias et l’immense majorité des populations concernées. La surprise réside dans le fait que ces termes frappent par leur faible valeur descriptive ou analytique, quand ils ne frappent pas plus fort encore par leur inadéquation.

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Lire l'article publié dans Cybergeo : European Journal of Geography

Toutes les analyses et commentaires des chercheur-euses de la Faculté des sciences de la société

Didier Wernli
Senior lecturer, Global Studies Institute, University of Geneva

project partners

Professor Nicolas Levrat
Full Professor, Global Studies Institute, University of Geneva

PHD Dr. Tediosi Fabrizio
Schweizerisches Tropen- und Public Health-Institut, University of Basel

Professor Karl Blanchet
Full Professor, Geneva Centre for Education & Research in Humanitarian Action, University of Geneva

Professor Didier Pittet
Full Professor, Department of Medicine, Faculty of Medicine, University of Geneva & Head, Division of Infection Prevention and Control, Geneva Universty Hospitals

summary

The current COVID-19 crisis is causing widespread disruption in health, economic and social systems worldwide. The response to this ongoing pandemic is unprecedented. As stressed by WHO Director General, “all countries must strike a fine balance between protecting health, minimizing economic and social disruption, and respecting human rights”. Over the past couple of decades, globalization and growing interdependencies have benefited the many. However, the financial crisis of 2008, the Ebola crisis in 2014-2015 and now COVID-19 are examples of systemic crises that can threaten modern societies. Based on insights from the governance of complex systems and resilience, this project aims to assess the initial impact of and responses to the current COVID-19 systemic crisis from an interdisciplinary perspective combining insights from public health, economics and law and understand how we can improve the resilience of our governance systems.

Funding

FNS

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Fiorenza Gamba
Chargée d'enseignement et Collaboratrice scientifique, Institut de recherche sociologique, Faculté des sciences de la société, Université de Genève & professeure associée de Sociologie de la Culture et de la Communication au Département de Sciences Economiques et de l'Entreprise, Université de Sassari

Marco Nardone
Doctorant FNS, Institut de recherche sociologique, Faculté des sciences de la société, Université de Genève

Toni Ricciardi
Collaborateur scientifique, Institut de recherche sociologique, Faculté des sciences de la société, Université de Genève

Professeur Sandro Cattacin
Professeur ordinaire, Institut de recherche sociologique, Faculté des sciences de la société, Université de Genève

Contributions

Thomas Abel, Antonio Abellan Garcia, Mathilde Bourrier, Jean-Michel Bonvin, Claudine Burton-Jeangros, Sandro Cattacin, Nicola Cianferoni, Ruxandra Oana Ciobanu, Bernard Debarbieux, Vera de Bel, Maxime Felder, Fiorenza Gamba, Olga Ganjour, Myriam Girardin, Marco Nardone, Michel Oris, Loïc Pignolo, Rogelio Pujol Rodriguez, Diego Ramiro Farinas, Toni Ricciardi, Emilie Rosenstein, Marlyne Sahakian, Sébastien Salerno, Daniel Stoecklin, Philippe Wanner, Eric D. Widmer, Marie-Eve Zufferey.

Résumé

En pleine pandémie, les sciences sociales sont plus que jamais appelées à mettre leurs connaissances et leurs outils d’analyse au service de la société. Avec la parution de "COVID-19. Le regard des sciences sociales", des sociologues, des démographes et des historiens nous fournissent des outils pour décrypter la tourmente provoquée par le coronavirus.
Ce livre, qui paraît le 18 juin aux Éditions Seismo (Zurich et Genève), regroupe les contributions inédites de 27 chercheuses et chercheurs. Issu de la Faculté des sciences de la société de l’Université de Genève, son objectif est de saisir les nombreuses implications sociales d’une pandémie qui, depuis plusieurs mois, désoriente et bouleverse les États et les rapports sociaux.  
L’ouvrage est le fruit d’un travail collectif et interdisciplinaire. Divisé en cinq parties, il aborde à tour de rôle les dynamiques historiques, communicationnelles et consuméristes ; les élans de solidarités et les nouvelles appartenances ; l’exacerbation des vulnérabilités chez les personnes âgées, les enfants, les personnes en situation de handicap ou en détention ; la gestion sanitaire de la crise, entre responsabilité individuelle et collective ; et enfin la fonction d’orientation des sciences sociales.

Plus d'informations

Communiqué de presse
Résumé complet de l'éditeur

 

COVID-19 et action humanitaire / COVID-19 and humanitarian activity

Professor Karl Blanchet
Geneva Centre for education and research in humanitarian action (CERAH), University of Geneva

summary

"COVID-19 Humanitarian" is an open-access platform that promotes the exchange of field-based COVID-19 programme adaptations and innovations, facilitating learning among organizations in different sectors and contexts.

partner institutions

Humanitarian Crises Centre of the London School of Hygiene and Tropical Medicine;
Johns Hopkins Centre for Humanitarian Health

Funding

Fondation privée des HUG

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Website https://www.covid19humanitarian.com/

 

Professor Karl Blanchet
Geneva Centre for education and research in humanitarian action (CERAH), University of Geneva

summary

Webinar series "COVID-19 & Humanitarian: Experience and Knowledge Sharing". Each week the three hosting organisations invited relevant speakers to discuss a topic related to the impact of the epidemic on the humanitarian sector.

partner institutions

Humanitarian Crises Centre of the London School of Hygiene and Tropical Medicine;
Johns Hopkins Centre for Humanitarian Health

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All the webinars already organised are available here: https://www.cerahgeneve.ch/events/news/archive/covid-19-humanitarian-settings/

 

Professor Karl Blanchet
Geneva Centre for education and research in humanitarian action (CERAH), University of Geneva
Humanitarian Encyclopedia Team

summary

As part of the CERHAH's engagement in the response to COVID-19, the HE Team has prioritised analysis of concepts relevant to the crisis and its impact on humanitarian situations.

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Website dedicated to COVID-19 to analysis concepts

 

Mara Tignino
Maître d'enseignement et de recherche, Département de droit international public et organisation internationale, Faculté de droit, Université de Genève

Plus d'informations 

Blog Article "Water for the Most Vulnerable Could Help Stop Spread of Covid-19", on Newsecuritybeat.org 

Blog Article "COVID-19 shos why protecting water in conflict is vital", on Conflict and environment Observatory website

Technologies de l'information et de la communication / Information and Communication Technologies

Professor Francois Grey
Associate professor, Citizen Cyberlab (CUI), University of Geneva

summary

Combining crowdsourcing and AI to extract key information about Covid-related topics from scientific literature or filer useful images from social media.

partner Institutions

University of Zurich and ETH Zurich
Politecnico Di Milano
Université de Paris
CSIC Barcelona

 

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Devpost on CrowdvsCovid
AI and Crowdsourcing for Tackling the Pandemic

 

 

 

Professor Katarzyna Wac
Visiting professor, Institute of Services Science / Quality of Life, University of Geneva
Geneva School of economics and management & University Computer Centre, University of Geneva

summary

We are inteersted in general public knowledge about and attitudes towards well-being- and health-related studies. A well-being or health-related study is where researchers collect information from people to improve their well-being and develop or evaluate new treatments, e.g., at the individual level or the population level. Although our interest is generic, we have specific questions on motivational factors related to well-being and health-related studies in the times of COVID.

partner institutions

University of Copenhagen, Denmark

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Link to the survey

 

 

 

 

Professor Katarzyna Wac
Visiting professor, Institute of Services Science / Quality of Life, University of Geneva
Geneva School of economics and management & University Computer Centre, University of Geneva

summary

The GUARDIAN project introduces a social companion, which aims to be of direct benefit for homecare nurses who are unable to visit the elderly patients at this time.

partner institutions

Vilans (coordinator and end-users), Netherlands
Zorggroep Noordwest-Veluwe (both: end-users), Netherlands
ConnectedCare, Netherlands
smartrobot.solutions (SMEs), Netherlands
Eindhoven University of Technology, Netherlands
JEF (SME), Italy
Università Politecnica delle Marche, Italy
INCRA (end-user), Italy
Hospital University of Geneva (end-user)

Funding

EU AAL-GUARDIAN (AAL-2019-6-120-CP) (2020-2022)

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Article about the project on Vilans.nl

 

 

 

Professor Katarzyna Wac
Visiting professor, Institute of Services Science / Quality of Life, University of Geneva
Geneva School of economics and management & University Computer Centre, University of Geneva

summary

Quantified Flu is a project exploring personal tracking and infectious disease. There is past preliminary data which shows that the data from wearables (like resting heart rate and sleep quality) might be predictive of coming down with a flu and the common cold. We evaluate it for COVID-19.

partner institutions

Led by Open Humans Foundation (USA)

Funding

Open Humans Foundation (USA)

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Quantifiedflu website

 

 

 

Professor Michel Deriaz
Senior lecturer, Institute of Services Science /  TaM, University of Geneva
Geneva School of economics and management & University Computer Centre, University of Geneva

summary

Life is too short to wait!
QueueForMe lets users to subscribe to virtual waiting queues, for instance in airports, hospitals, or busy food trucks, and to be notified when their turn arrives. The innovation is the use of a generic machine learning algorithm applied to queue modeling, to compute the best estimated waiting time.

partner institutions

Labsis Sàrl

funding

Innosuisse

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QueueForMe website

Article in IngFlash nr 60 

 

 

 

Professor Katarzyna Wac
Visiting professor, Institute of Services Science / Quality of Life, University of Geneva
Geneva School of economics and management & University Computer Centre, University of Geneva

summary

APP PITCH: Either you are frequent or occasional user of TPG services and you want more comfort during your commutes, we have a service designed for you!
UnCrowd TPG can change the way you will experience public transport in Geneva. By combining real-time public transport data with live crowd inputs from other UnCrowd TPG users, commuters like you can get suggestions about the most comfortable and less crowded way to travel. You can contribute while you enjoy UnCrowd TPG features for free!

project partner

Part of thesis of Dr Mattia GUSTARINI, MobileThinking.ch

Funding

Internal CUI/ISS, partially SNSF PCS-OBEY
TPG

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Full summary of the project

 

 

 

recherches associées / Related research

Professor Pierrette Bouillon
Full professor, Faculty of Translation and Interpreting (FTI), University of Geneva

summary

BabelDR helps medical professionals at HUG (University Hospital Geneva), particularly in the emergency and immigrant health service departments, to communicate with patients who have no language in common. BabelDR is a spoken language translation system of dialogues in the medical domain that includes Tigrinya, Arabic, Farsi, Albanian, Spanish and Sign language. In order to face the actual sanitary crisis, the Covid 19 domain has been added to the system.

partner institutions

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Funding

Fondation privée des HUG

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Full Summary of the project

List of publications

 

 

 

Professeure Anne-Sylvie Dupont
Professeure ordinaire, Département de droit public, Faculté de droit, Université de Genève

résumé

La crise sanitaire provoquée par le SARS-Cov2 entraîne une sollicitation ac-crue du système de soins. Or, la nouvelle loi sur les épidémies ne traite que de manière succincte du financement de ces soins, postulant la subsidiarité de l’intervention des pouvoirs publics par rapport à celle des assurances sociales. Les semaines qui viennent de s’écouler ont montré que l’articulation entre la loi sur les épidémies et la législation en matière d’assurances sociales est tout sauf claire, de même que les conditions de l’intervention de certaines assurances sociales, à commencer par l’intervention de l’assurance-accidents en cas de maladie professionnelle.

Plus d'informations

Anne-Sylvie Dupont, "La prise en charge des soins de santé en cas d’épidémie", in : Jusletter 22 juin 2020.

 

 

 

 

Professor Marie Schneider
Adjunct professor, Pharmaceutical sciences section, Faculty of sciences, University of Geneva

Summary

We will analyse retrospectively adherence to chronic medications in patients during the COVID pandemic. We will compare medication adherence before - during - after the confinement, and analyse how the confinement, as an independent variable, influences adherence to chronic treatments.

Project partners

Pr. Matthias Cavassini, CHUV, UniL;
Pr. Chantal Csajka, ISPSO, UNIGE, UniL;
Dre Dorothea Wagner, oncology, CHUV;
Dre Anne Zanchi, diabetology and nephrology, CHUV.

Funding

Part of funding for research in medication adherence (2 grants)

Prof. Aleksey Tetenov
Full Professor, Institute of Economics and Econometrics, Geneva School of Economics and Management, University of Geneva

SUMMARY

As the COVID-19 pandemic progresses, researchers are reporting findings of randomized trials comparing standard care with care augmented by experimental drugs. The trials have small sample sizes, so estimates of treatment effects are imprecise. Seeing imprecision, clinicians reading research articles may find it difficult to decide when to treat patients with experimental drugs. Whatever decision criterion one uses, there is always some probability that random variation in trial outcomes will lead to prescribing sub-optimal treatments. A conventional practice when comparing standard care and an innovation is to choose the innovation only if the estimated treatment effect is positive and statistically significant. This practice defers to standard care as the status quo. To evaluate decision criteria, we use the concept of near optimality, which jointly considers the probability and magnitude of decision errors. An appealing decision criterion from this perspective is the empirical success rule, which chooses the treatment with the highest observed average patient outcome in the trial. Considering the design of recent and ongoing COVID-19 trials, we show that the empirical success rule yields treatment results that are much closer to optimal than those generated by prevailing decision criteria based on hypothesis tests.

PARTNER INSTITUTION

Prof. Charles F. Manski, Northwestern University, 

FUNDING

SNSF grant “Bringing Empirical Welfare Maximization methods to practice”

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Charles F. Manski, Aleksey Tetenov, "Statistical Decision Properties of Imprecise Trials Assessing COVID-19 Drugs", NBER Working Paper No. 27293, Issued in June 2020.

 

 

 

 

Professeur Alain Gervaix
Département de pédiatrie, gynécologie et obstétrique,  Faculté de médecine, Université de Genève & médecin-chef du Service d'accueil et d'urgences pédiatriques, Département de la femme, de l'enfant et de l'adolescent, Hôpitaux universitaires de Genève

Dr Aymeric CantaixService d'accueil et d'urgences pédiatriques, Département de la femme, de l'enfant et de l'adolescent, Hôpitaux universitaires de Genève

Résumé

L’étude Covidoscope vise à mettre au point un stéthoscope électronique autonome embarquant un algorithme d’intelligence artificielle capable de reconnaître les bruits pulmonaires. L’analyse des bruits respiratoires des patients atteints de COVID-19 permettra de mettre au point l’intelligence artificielle capable de reconnaître automatiquement la maladie. Ce matériel pourra ensuite être utilisé à l’hôpital, aussi bien qu’en ville (pharmacie, consultations) afin de screener et de suivre largement la population. Une utilisation directement par le patient est également à l’étude.

institutions partenaires

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Financement

Fondation privée des HUG

 

 

Professeure Dagmar M. Haller
Professeure assistante, Santé et Médecine Communautaire, Unité des Internistes Généralistes et Pédiatres,  Faculté de médecine, Université de Genève

résumé

Le projet a pour but d’explorer le vécu des médecin de ville lors du stage dans leur cabinet des étudiants en médecine 3MA en mai 2020, avec un focus sur la manière de maintenir le double rôle clinicien-enseignant en période de pandémie.

institutions partenaires

Projet coordonné par Dr Eva Pfarrwaller, UIGP et impliquant des médecins de famille genevois, chargés d'enseignement en cabinet

Plus d'informations 

COVID-19: projets de recherche menés par l'UIGP