Unité « Biologie et biotechnologie II »

Génétique médicale

Dans un contexte de génétique médicale, ce cours explique l’importance du recueil de l’histoire familiale et permet de comprendre les différents types de diagnostic et de dépistages pratiqués. En outre, l’enseignement permet aux étudiant-es d’expliquer le séquençage de l’exome, d’organiser les variants obtenus après séquençage du génome et de formuler la démarche pour identifier des variants causatifs d’une maladie génétique mendélienne.

A la suite du cours « La structure et la fonction des génomes de l’humain » en 2e année de bachelor, cet enseignement permet la mise en application des connaissances acquises précédemment à travers une série de travaux dirigés et pratiques. Ces séances permettent d’apprendre à prédire la fonction d’un variant, d’un élément, ou d’une séquence du génome humain en explorant et traitant les données issues de bases de données publiques.

Méthodes d’immunodétection

Composé de cours magistraux, de travaux pratiques et de travaux dirigés, cet enseignement aborde les différentes techniques d’immunodétection classiquement utilisés en laboratoire. Les travaux pratiques constituent la pierre angulaire de cette séquence d’enseignement et permettent de consolider les acquis concernant les bonnes pratiques de laboratoire (tenue d’un cahier de laboratoire, utilisation adéquate du matériel de laboratoire, réalisation d’un travail reproductible, etc.). L’objectif de ces travaux pratiques est de tester des anticorps produits par la plateforme universitaire « Geneva Antibody Facility »   avec les différentes méthodes d’immunodétection abordées pendant les cours. Les résultats générés dans le cadre de ces travaux pratiques sont mis en forme par les étudiant-es pour une publication dans le journal « Antibody Reports ».

Découvrez les publications des années précédentes ici : 

• Travaux 2021/2022
• Guilhen C, Mendes Ferreira V, Maag A, Lung M, Lopez P, Schär J, Prutyanova Y, Ollagnon M, Michel G, Calomeni A, Bury A, Boeva D, Bobillier M, Zholdokov M, Vigneau M, Tamrat B, Siebenmann E, Khadam-Al-Jame T, Gillet H, Garrido E, Farhat H, Berlincourt J, Baltazar L, Arbez T, Adomako B, Durual S. AF394, AF395, AF397, AK142, AK652, AN193 and AV441 antibodies label the GFP protein by western blot. Antib. Rep. 2022;5(1):e677
• Adomako B, Mendes Ferreira V, Michel G, Ollagnon M, Prutyanova Y, Schaer J, Siebenmann E, Tamrat B, Vigneau M, Zholdokov M, Hammel P, Durual S, Maag A, Lung M, Lopez P, Arbez T, Baltazar L, Berlincourt J, Bobillier M, Boeva D, Bury A, Calomeni A, Farhat H, Garrido E, Gillet H, Khadam-Al-Jame T, Guilhen C. AG275, AG294 and AG274 antibodies recognize the hen egg-white lysozyme by ELISA. Antib. Rep. 2022;5(1):e671
• Guilhen C, Khadam-Al-Jame T, Gillet H, Garrido E, Farhat H, Calomeni A, Bury A, Boeva D, Bobillier M, Berlincourt J, Baltazar L, Arbez T, Adomako B, Zholdokov M, Vigneau M, Tamrat B, Siebenmann E, Schär J, Prutyanova Y, Ollagnon M, Michel G, Mendes Ferreira V, Maag A, Lung Perez M, Lopez Naveira P, Marchetti A, Prodon F, Durual S. AC650, AC653, AC656 and AD460 antibodies label the human CD8α protein by immunofluorescence. Antib. Rep. 2022;5(1):e676
• Zholdokov M, Vigneau M, Tamrat B, Siebenmann E, Schär J, Prutyanova Y, Ollagnon M, Michel G, Mendes Ferreira V, Maag A, Lung M, Lopez P, Khadam-Al-Jame T, Gillet H, Garrido E, Farhat H, Calomeni A, Bury A, Boeva D, Bobillier M, Berlincourt J, Baltazar L, Arbez T, Adomako B, Marchetti A, Durual S, Aubry-Lachainaye J-P, Guilhen C. AC650, AC653, AC656 and AD460 antibodies recognize the human CD8α protein by flow cytometry. Antib. Rep. 2022;5(1):e670

• Travaux 2020/2021
• Gosetto M, Gil D, Poncet C, Volery M, Da Fonte S, Jaques E, El Matribi Z, Berkcan S, Payot N, Vaudano AP, Khatibi K, Nemeth A, Gozlugol E, Chammartin N, Lazzarotto C, Ollivier J, Oppliger E, Schmid MN, Bindschaedler C, Sassi A, Guilhen C, Aubry-Lachainaye J-P. AQ806, AS739, AT693, AU197 and AU734 antibodies recognize the spike S protein from SARS-CoV-2 by flow cytometry. Antib. Rep. 2021;4(1)
• Lazzarotto C, Schmid MN, Ollivier J, Vaudano AP, Da Fonte S, Payot N, Nemeth A, Bindschaedler C, Khatibi K, Chammartin N, Jaques E, El Matribi Z, Berkcan S, Volery M, Gozlugol E, Gosetto M, Oppliger E, Gil D, Poncet C, Sassi A, Guilhen C. AS739, AT693, AU197 and AU734 antibodies label the spike S protein from SARS-CoV-2 by western blot. Antib. Rep. 2021;4(1)
• Guilhen C, Chammartin N, Lazzarotto C, Da Fonte S, Nemeth A, Bindschaedler C, El Matribi Z, Berkcan S, Oppliger E, Gil D, Poncet C, Volery M, Gozlugol E, Gosetto M, Payot N, Khatibi K, Jaques E, Schmid MN, Ollivier J, Vaudano AP, Prodon F, Sassi A. AS739, AT693 and AU734 antibodies label the spike S protein from SARS-CoV-2 by immunofluorescence. Antib. Rep. 2021;4(1)
• Payot N, Vaudano AP, Khatibi K, Nemeth A, Gozlugol E, Chammartin N, Lazzarotto C, Ollivier J, Da Fonte S, Jaques E, El Matribi Z, Berkcan S, Gil D, Poncet C, Volery M, Bindschaedler C, Gosetto M, Oppliger E, Schmid MN, Didier M, Hammel P, Sassi A, Guilhen C. AS739, AT693 and AU734 antibodies recognize the spike S protein from SARS-CoV-2 by ELISA. Antib. Rep. 2021;4(1)
• Guilhen C, Oppliger E, Schmid MN, Bindschaedler C, Gosetto M, Poncet C, Volery M, Berkcan S, Gil D, Jaques E, El Matribi Z, Ollivier J, Da Fonte S, Chammartin N, Lazzarotto C, Vaudano AP, Gozlugol E, Nemeth A, Payot N, Khatibi K, Sassi A, Soulie P. AK247, AK249, AK250, AK280 and AK281 antibodies label mouse glucagon-secreting alpha cells by immunohistochemistry. Antib. Rep. 2021;4(1)

Ce cours présente les structures et fonctions des différentes classes de lipides, leurs différentes voies métaboliques ainsi que les principes généraux gouvernant leur régulation et leur interaction. Il discute leur importance pour la nutrition et la balance énergétique ainsi que leur rôle dans les désordres lipidiques.

L’objectif de cet enseignement est de maîtriser l’utilisation d’un nombre important de ressources bio-informatiques (bases de données, data mining, outils d’analyse de séquence de protéine, logiciel BLAST) afin de prédire la fonction d’une protéine humaine encore non-caractérisée.

Ce cours apporte des connaissances sur les différents éléments qui composent un vecteur d’expression et permet aux étudiant-es d’apprendre à manipuler des séquences codantes, faire de la culture cellulaire dans des conditions d’asepsie strictes et doser et caractériser une protéine recombinante. Le cours apporte également des connaissances sur les biomarqueurs, leur développement et leur rôle dans la santé publique. 

Cet enseignement permet l’acquisition des compétences de programmation pratiques pour accéder à et analyser des données biologiques disponibles sur le net. Lors des travaux pratiques vous vous familiarisez avec les bonnes pratiques de programmation à travers l’apprentissage du langage de programmation Python et sa mise en pratique lors d’exercices de codage.