Unité « Biologie et biotechnologie II »
Génétique médicale
Dans un contexte de génétique médicale, ce cours explique l’importance du recueil de l’histoire familiale et permet de comprendre les différents types de diagnostic et de dépistages pratiqués. En outre, l’enseignement permet aux étudiant-es d’expliquer le séquençage de l’exome, d’organiser les variants obtenus après séquençage du génome et de formuler la démarche pour identifier des variants causatifs d’une maladie génétique mendélienne.
Biologie du génome humain
A la suite du cours « La structure et la fonction des génomes de l’humain » en 2e année de bachelor, cet enseignement permet la mise en application des connaissances acquises précédemment à travers une série de travaux dirigés et pratiques. Ces séances permettent d’apprendre à prédire la fonction d’un variant, d’un élément, ou d’une séquence du génome humain en explorant et traitant les données issues de bases de données publiques.
Méthodes d’immunodétectionComposé de cours magistraux, de travaux pratiques et de travaux dirigés, cet enseignement aborde les différentes techniques d’immunodétection classiquement utilisés en laboratoire. Les travaux pratiques constituent la pierre angulaire de cette séquence d’enseignement et permettent de consolider les acquis concernant les bonnes pratiques de laboratoire (tenue d’un cahier de laboratoire, utilisation adéquate du matériel de laboratoire, réalisation d’un travail reproductible, etc.). L’objectif de ces travaux pratiques est de tester des anticorps produits par la plateforme universitaire « Geneva Antibody Facility » avec les différentes méthodes d’immunodétection abordées pendant les cours. Les résultats générés dans le cadre de ces travaux pratiques sont mis en forme par les étudiant-es pour une publication dans le journal « Antibody Reports ».
Découvrez les publications des années précédentes ici :
Travaux 2022-2023
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Dawit S, Schwitzguebel V, Seddiki W, Soulié P, Anagbogu N, Bennani K, Brun E, Butterworth H, Carry J, Aubry-Lachainaye J-P, Gameiro C, Durual S, Jauslin T, Ruetsche A, Roch L, Diep M-M-L, fer O, Guertler M, Gureu C, Herren M, leyss S, Liborova K, Maître M, Manghetti L, Mencier L, Moudarres L, Najand G, Guilhen C. AD822, AW199, AW200 and AW201 antibodies against the human Fas receptor (CD95) bind the surface of HEK293 cells as revealed by flow cytometry. Antib. Rep. 2023;6(1):e1143
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Herren M, Leyss S, Liborova K, Maître M, Manghetti L, Mencier L, Moudarres L, Najand G, Roch L, Ruetsche A, Schwitzguebel V, Seddiki W, Soulie P, Anagbogu N, Bennani K, Brun E, Butterworth H, Carry J, Dawit S, Diep M-M-L, Ferrillo O, Guertler M, Gureu C, Prodon F, Durual S, Jauslin T, Guilhen C. AF641, AI954 and AW954 antibodies label the endoplasmic reticulum by immunofluorescence. Antib. Rep. 2023 ;6(1):e1134
Travaux 2021-2022
- Guilhen C, Mendes Ferreira V, Maag A, Lung M, Lopez P, Schär J, Prutyanova Y, Ollagnon M, Michel G, Calomeni A, Bury A, Boeva D, Bobillier M, Zholdokov M, Vigneau M, Tamrat B, Siebenmann E, Khadam-Al-Jame T, Gillet H, Garrido E, Farhat H, Berlincourt J, Baltazar L, Arbez T, Adomako B, Durual S. AF394, AF395, AF397, AK142, AK652, AN193 and AV441 antibodies label the GFP protein by western blot. Antib. Rep. 2022;5(1):e677
- Adomako B, Mendes Ferreira V, Michel G, Ollagnon M, Prutyanova Y, Schaer J, Siebenmann E, Tamrat B, Vigneau M, Zholdokov M, Hammel P, Durual S, Maag A, Lung M, Lopez P, Arbez T, Baltazar L, Berlincourt J, Bobillier M, Boeva D, Bury A, Calomeni A, Farhat H, Garrido E, Gillet H, Khadam-Al-Jame T, Guilhen C. AG275, AG294 and AG274 antibodies recognize the hen egg-white lysozyme by ELISA. Antib. Rep. 2022;5(1):e671
- Guilhen C, Khadam-Al-Jame T, Gillet H, Garrido E, Farhat H, Calomeni A, Bury A, Boeva D, Bobillier M, Berlincourt J, Baltazar L, Arbez T, Adomako B, Zholdokov M, Vigneau M, Tamrat B, Siebenmann E, Schär J, Prutyanova Y, Ollagnon M, Michel G, Mendes Ferreira V, Maag A, Lung Perez M, Lopez Naveira P, Marchetti A, Prodon F, Durual S. AC650, AC653, AC656 and AD460 antibodies label the human CD8α protein by immunofluorescence. Antib. Rep. 2022;5(1):e676
- Zholdokov M, Vigneau M, Tamrat B, Siebenmann E, Schär J, Prutyanova Y, Ollagnon M, Michel G, Mendes Ferreira V, Maag A, Lung M, Lopez P, Khadam-Al-Jame T, Gillet H, Garrido E, Farhat H, Calomeni A, Bury A, Boeva D, Bobillier M, Berlincourt J, Baltazar L, Arbez T, Adomako B, Marchetti A, Durual S, Aubry-Lachainaye J-P, Guilhen C. AC650, AC653, AC656 and AD460 antibodies recognize the human CD8α protein by flow cytometry. Antib. Rep. 2022;5(1):e670
Travaux 2020-2021
- Gosetto M, Gil D, Poncet C, Volery M, Da Fonte S, Jaques E, El Matribi Z, Berkcan S, Payot N, Vaudano AP, Khatibi K, Nemeth A, Gozlugol E, Chammartin N, Lazzarotto C, Ollivier J, Oppliger E, Schmid MN, Bindschaedler C, Sassi A, Guilhen C, Aubry-Lachainaye J-P. AQ806, AS739, AT693, AU197 and AU734 antibodies recognize the spike S protein from SARS-CoV-2 by flow cytometry. Antib. Rep. 2021;4(1)
- Lazzarotto C, Schmid MN, Ollivier J, Vaudano AP, Da Fonte S, Payot N, Nemeth A, Bindschaedler C, Khatibi K, Chammartin N, Jaques E, El Matribi Z, Berkcan S, Volery M, Gozlugol E, Gosetto M, Oppliger E, Gil D, Poncet C, Sassi A, Guilhen C. AS739, AT693, AU197 and AU734 antibodies label the spike S protein from SARS-CoV-2 by western blot. Antib. Rep. 2021;4(1)
- Guilhen C, Chammartin N, Lazzarotto C, Da Fonte S, Nemeth A, Bindschaedler C, El Matribi Z, Berkcan S, Oppliger E, Gil D, Poncet C, Volery M, Gozlugol E, Gosetto M, Payot N, Khatibi K, Jaques E, Schmid MN, Ollivier J, Vaudano AP, Prodon F, Sassi A. AS739, AT693 and AU734 antibodies label the spike S protein from SARS-CoV-2 by immunofluorescence. Antib. Rep. 2021;4(1)
- Payot N, Vaudano AP, Khatibi K, Nemeth A, Gozlugol E, Chammartin N, Lazzarotto C, Ollivier J, Da Fonte S, Jaques E, El Matribi Z, Berkcan S, Gil D, Poncet C, Volery M, Bindschaedler C, Gosetto M, Oppliger E, Schmid MN, Didier M, Hammel P, Sassi A, Guilhen C. AS739, AT693 and AU734 antibodies recognize the spike S protein from SARS-CoV-2 by ELISA. Antib. Rep. 2021;4(1)
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Guilhen C, Oppliger E, Schmid MN, Bindschaedler C, Gosetto M, Poncet C, Volery M, Berkcan S, Gil D, Jaques E, El Matribi Z, Ollivier J, Da Fonte S, Chammartin N, Lazzarotto C, Vaudano AP, Gozlugol E, Nemeth A, Payot N, Khatibi K, Sassi A, Soulie P. AK247, AK249, AK250, AK280 and AK281 antibodies label mouse glucagon-secreting alpha cells by immunohistochemistry. Antib. Rep. 2021;4(1)
Travaux 2019-2020
- Maxit O, Ameti I, Hussami S, Spedaliero S, Manoukian A, Richard M, Verdon M, Bulla M, Sassi A, Guilhen C. The AJ521 antibody labels the human CD1b protein by immunofluorescence. Antib. Rep. 2020;3(1):e121
- Cino A, Domingos E, Gueorguiev B, Haraj M, D’Esposito A, Pirek C, Arsimoles D, Bulla M, Sassi A, Guilhen C. The AJ521 antibody detects the human CD1b protein by western blot. Antib. Rep. 2020;3(1):e122
- Arsimoles D, D’Esposito A, Gaspoz V, Pirek C, Laszlo A, Longepierre M, Giusti T, Bulla M, Sassi A, Guilhen C. The AJ519 antibody labels the human TAC/IL2RA protein by immunofluorescence. Antib. Rep. 2020;3(1):e118
- Laszlo A, Bosshard E, Maxit O, Spedaliero S, Richard M, Bulla M, Sassi A, Aubry-Lachainaye J-P, Guilhen C. The AJ521 antibody detects the human CD1b protein by flow cytometry. Antib. Rep. 2020;3(1):e120
- Bosshard E, Celeny D, Laszlo A, Longepierre M, Richard M, Verdon M, Bulla M, Sassi A, Guilhen C. The AJ519 antibody detects the human TAC/ILR2A protein by western blot. Antib. Rep. 2020;3(1):e119
- Gueorguiev B, Domingos E, Gaspoz V, Arsimoles D, Haraj M, Bulla M, Sassi A, Aubry-Lachainaye J-P, Guilhen C. The AJ519 antibody detects the human TAC/ILR2A protein by flow cytometry. Antib. Rep. 2020;3(1):e117
- Domingos E, Cino A, Gueorguiev B, Haraj M, Bosshard E, Celeny D, Bulla M, Sassi A, Guilhen C. The AJ517 antibody labels the mouse CD8β protein by immunofluorescence. Antib. Rep. 2020;3(1):e115
- Ameti I, Hussami S, Maxit O, Spedaliero S, Gaspoz V, Giusti T, Manoukian A, Bulla M, Sassi A, Guilhen C. The AJ517 antibody labels the mouse CD8β protein by western blot. Antib. Rep. 2020;3(1):e116
- D’Esposito A, Manoukian A, Pirek C, Verdon M, Giusti T, Bulla M, Sassi A, Aubry-Lachainaye J-P, Guilhen C. The AJ517 antibody detects the mouse CD8β protein by flow cytometry. Antib. Rep. 2020;3(1):e114
- Hussami S, Ameti I, Celeny D, Longepierre M, Cino A, Bulla M, Sassi A, Aubry-Lachainaye J-P, Guilhen C. The AJ516 antibody does not detect the human CD1a protein by flow cytometry. Antib. Rep. 2020;3(1):e113
- D’Esposito A, Guilhen C, Soulié P. AE804, AE806, AE999, AF017, AF041 and AF131 antibodies label mouse insulin-secreting beta cells by immunohistochemistry. Antib. Rep. 2020;3(1):e125
- Guilhen C. AI239, RB94 and RB95 antibodies recognize the Glutathione S-transferase protein by ELISA. Antib. Rep. 2019;2(4):e101
Protéines recombinantes
Ce cours apporte des connaissances sur les différents éléments qui composent un vecteur d’expression et permet aux étudiant-es d’apprendre à manipuler des séquences codantes, faire de la culture cellulaire dans des conditions d’asepsie strictes et doser et caractériser une protéine recombinante. Le cours apporte également des connaissances sur les biomarqueurs, leur développement et leur rôle dans la santé publique.
Biochimie
Après un rappel sur les structures et les fonctions des lipides, des glucides et des protéines. ce cours présente les principales méthodes de chimie analytique utilisées pour analyser des macromolécules. A travers des ateliers de travaux dirigés, les étudiant-es découvriront également les outils bio-informatiques permettant de prédire la structure et la fonction des protéines.
