Emmanuel Kabengele Mpinga obtient en 1993 une maîtrise en administration et gestion des institutions sanitaires en République démocratique du Congo. Entre 1988 et 1997 il est responsable de planification et évaluation des soins de santé primaires pour le Ministère de la santé et secrétaire général du Comité pour la démocratie et les droits de l’homme (CDDH). Arrivé en Suisse, il se spécialise en droits économiques, sociaux et culturels au Collège universitaire Henry Dunant. Il obtient en 2002 un master en santé publique de l’UNIGE puis, en 2007, un doctorat en politiques et systèmes de santé à l’Institut universitaire Kurt Bösch de Sion. Il rejoint en 2002 l’Institut de médecine sociale et préventive (IMSP), devenu depuis l’Institut de santé globale, rattaché au Département de santé et médecine communautaire de la Faculté de médecine. Nommé en 2008 professeur assistant à la Swiss School of Public Health et à la Faculté de médecine de l’UNIGE, puis professeur associé en 2013, il prend sa retraite facultaire en septembre 2025. 

Spécialiste de l’épistémologie de la santé et des droits humains, Emmanuel Kabengele Mpinga est également expert auprès du Département des affaires politiques des Nations Unies (DPA), d’agences intergouvernementales et d’ONGs internationales dans les domaines de la recherche et consolidation de la paix, de la santé publique et des droits humains. Il est membre de nombreuses sociétés savantes et membre de comités de lecture auprès de plusieurs revues internationales.