Gérer ses références numériques
Quart d'heure technologique du 14 décembre 2010
En 2003, presque tous les journaux scientifiques proposaient une version numérique de leurs publications (Renear et Palmer, 2009). Il a fallu presque 10 ans pour y arriver. Durant la même période, les scientifiques sont passés d'une lecture d'environ 188 articles par an à 280 articles. Toutefois le temps de lecture par article a diminué, passant d’environ 47min/article à 31min/article, ce qui donne un temps total de lecture par an à peu près constant d’environ 145 heures (Tenopir et King, 2008). C’est un temps considérable, qu’il faut valoriser en utilisant de bons outils bibliographiques. Cet article en présente deux : Zotero et Mendeley
Zotero
Collecter
Zotero est capable de «sentir» le type de page visitée, c’est-à-dire de savoir s’il s’agit d’un catalogue, d’un article d’une revue scientifique ou d’un journal. Si la page est reconnue, une icône ad hoc est affichée à droite de l’URL du site web. Un clic sur cette icône permet de récupérer les méta-données liées au document. Deux exemples :
Base de donnée
Faites une recherche dans la base de donnée Pubmed. Une fois les documents correspondant à votre recherche affichés, observez l’icône jaune « dossier » à droite de l’URL. Un clic sur cette icône affichera la liste de tous les documents de la page, vous permettant ainsi de choisir ceux dont vous voulez importer les données bibliographiques. Remarquez que les termes MESH sont également importés (bouton « Marqueurs » du panneau droite)
Article scientifique
Consultez par exemple la dernière publication de la revue Nature, cliquez sur le titre d’un article. Observez l’icône d’une feuille lignée à droite de l’URL. Un clic sur l’icône importera les données bibliographiques de l’article et, pour autant que vous ayez choisi l’option “Joindre automatiquement les fichiers PDF associés lors de l’enregistrement d’un élément dans les préférences de Zotero, le fichier sera également importé sur votre ordinateur
D’autres modes d’enregistrement sont disponibles:
- à partir d’un identifiant unique d’un élément (DOI, PMID, ISBN)
- alternativement, Zotero permet d’enregistrer un nouvel élément manuellement en remplissant un formulaire correspondant au type de document choisi (chapitre de livre, présentation à une conférence, ...)
- on peut également enregistrer une copie de la page web visitée et les méta-données associées (URL, date d’accès)
Pour chaque élément entré dans la base de donnée, on peut compléter l’information associée (Info), ajouter une ou plusieurs notes (Notes), ajouter des mots-clés (Marqueurs), ajouter un lien vers un ou plusieurs autres éléments enregistrés dans la base de donnée (Connexe)
Organiser
Afin d’avoir un meilleure vision du contenu de la bibliothèque, il est recommandé d’organiser les éléments enregistrés sous la forme de collections. Un même élément peut être mis dans plusieurs collections. Pour se faire, créez un collection avec le bouton ad hoc et glissez l’élément dans la ou les collections désirées. Ce faisant, l’élément n’est pas physiquement déplacé ou dupliqué, c’est simplement un alias de l’élément qui est à chaque fois créé.
Chercher
Zotero contient un moteur de recherche raffiné qui permet une recherche multi-critères et d’enregistrer une recherche complexe afin de pouvoir la réutiliser ultérieurement.
Accéder
Grâce à un mécanisme de synchronisation entre votre ordinateur et le serveur Zotero, vos références sont consultables à l’aide de n’importe quel navigateur depuis n’importe où et en tout temps. Zotero met gratuitement à disposition 100 Mb sur leur serveur. Cela correspond à environ 200 références avec le fichier pdf associé. Contre paiement annuel, de l’espace supplémentaire est disponible: 1Gb=$20, 5Gb=$60, 10Gb=$100, 25Gb=$240.
Si vous désirez modifier ou ajouter un nouvel élément depuis un autre ordinateur (par exemple à la maison), il faut installer Zotero sur cet ordinateur et le synchroniser avec le serveur Zotero. Une modification faite depuis une installation sera automatiquement répercutée sur toutes les autres installations.
Partager
Grâce à la possibilité de créer des groupes, Zotero permet de partager une bibliographie avec, par exemple, les membres d’un même laboratoire ou des personnes collaborant sur un même projet. Suivant le degré de visibilité et le mode d’inscription, trois types de groupes sont disponibles:
- privé: aucune exposition publique et seuls les utilisateurs Zotero invités peuvent devenir membre
- public avec participation restreinte: tout ou une partie des documents du groupe sont visibles et l’entrée dans le groupe passe par une demande d’invitation
- public avec participation ouverte: comme ci-dessus, mais tout le monde peut devenir membre instantanément.
Le créateur et administrateur d’un groupe peut définir qui peut voir les éléments de la bibliothèque du groupe et qui peut éditer ou ajouter des éléments. Outre les éléments d’interaction intrinsèque à Zotero (ajout, modification d’éléments), la page web du groupe contient un forum de discussion utile pour la collaboration à distance.
Citer
Tout comme EndNote, Zotero permet de citer des références et créer des bibliographies directement dans un système de traitement de texte (MS Word ou OpenOffice). Pour ce faire, il faut installer une extension au logiciel de traitement de texte. Ceci fait un menu propre à Zotero sera disponible dans le logiciel de traitement de texte. On utilisera ce menu pour citer une ou plusieurs références dans le texte et générer une bibliographie finale selon le style du journal désiré.
Et la suite ?
Depuis sa première sortie en 2006, Zotero a constamment évolué grâce à des fondations à but non lucratif qui financent les développements. Ainsi, des versions fonctionnant avec les navigateurs Google Chrome, Apple Safari, et Microsoft Internet Explorer sont annoncées. De même une version indépendante de tout navigateur est également prévue. Comme en recherche, ces avancées sont en partie le résultat d’une compétition entre les différents outils de gestion bibliographique. Ainsi, un nouveau venu, Mendeley, fait déjà beaucoup parler de lui et fait de l’ombre à Zotero.
Mendeley
- usage gratuit
- collecte automatique des méta-données liées aux articles scientifiques
- base de donnée bibliographique accessible depuis n’importe où grâce à une version web et à une synchronisation entre les données locales et celles stockées sur le serveur. La version web est beaucoup plus riche que celle de Zotero (cf ci-dessous)
- création de groupes privés ou publiques pour faciliter la collaboration
- intégration avec les logiciels de traitement de texte pour citer et créer automatiquement une liste de références bibliographiques
Que choisir ?
De nombreux détails distinguent toutefois les deux outils, certains sont en faveur de Zotero, d’autres en faveur de Mendeley. Par exemple:
en faveur de Zotero
- c’est un projet “open source”, c’est à dire que la communauté a la possibilité d’accéder au code source et de l’améliorer, et qui n’a pas d’ambition lucrative
- une gestion simple et intégrée au navigateur
- récupération automatique des documents pdf
- ajout de toutes sortes de documents (pdf, capture d'écran, images, docs)
en faveur de Mendeley
- des ressources financières et humaines importantes ont été mis en oeuvre, ce qui devrait permettre un développement rapide.
- la version web est très riche
- la majorité des fonctions de la version desktop sont disponibles (ajouter, modifier, effacer une référence, création de collection, tri, recherche)
- statistiques sur le lectorat, indication des domaines “chauds”, propositions automatiques d’articles voisins
- un espace web gratuit de 1Gb, soit 10x plus grand que celui offert par Zotero. De l'espace supplémentaire peut être acheté.
- orienté vers un public de chercheurs en sciences
Le choix de l’un ou l’autre des outils est affaire de préférences personnelles. Si vous ne connaissez ni l’un ni l’autre, le mieux est de faire un essai ou de regarder les vidéos introductives. Quelque soit votre choix, sachez que vous n’êtes pas prisonnier car chacun des outils propose un mécanisme d’exportation de votre bibliothèque. Mendeley peut même puiser directement dans la base de donnée de Zotero pour importer votre bibliographie et les documents pdf associés.
Les sites web suivants comparent différents outils de gestion bibliographique:
- Wikipedia, 28 systèmes différents sous la loupe sur Wikipedia
- En coup d’oeil, comparez les fonctions principales de 6 outils
- EndNote, RefWorks, Zotero et Mendeley comparés par des bibliothécaires de l’UC Berkeley
- Deux articles récents (juillet et septembre 2010) parus dans The Chronicle of Higher Education:
Bibliographie
- Renear, Allen H, et Carole L Palmer. 2009. Strategic reading, ontologies, and the future of scientific publishing. Science (New York, N.Y.) 325, n°. 5942 (Août 14): 828-832. doi:10.1126/science.1157784.
- Tenopir, Carol, et Donald W. King. 2008. Electronic Journals and Changes in Scholarly Article Seeking and Reading Patterns. D-Lib Magazine 14, n°. 11 (11). doi:10.1045/november2008-tenopir. http://www.dlib.org/dlib/november08/tenopir/11tenopir.html.
3 déc. 2010