Joyeux anniversaire à l'Institut Suisse de Bioinformatique
Le 30 mars 2008 marque une étape importante pour l’Institut Suisse de Bioinformatique (ISB). Ce jour-là, l’institut a fêté non seulement le 10ème anniversaire de sa création, mais également les anniversaires de la mise sur pied d’un certain nombre de services, bases de données et outils informatiques que l’institut met à disposition de la communauté scientifique internationale dans le domaine des sciences de la vie depuis de nombreuses années. On compte parmi ceux-ci: ExPASy, SWISS-MODEL et SWISS-2DPAGE qui célèbrent leurs 15 ans de service, PROSITE qui a 20 ans et Mélanie 25 ans.
L’ISB, l’une des institutions de référence mondiale dans le domaine de la bioinformatique, a été fondé le 30 mars 1998 grâce à l’enthousiasme et l’engagement d’un petit groupe de scientifiques d’exception, ainsi qu’au soutien de quelques politiciens suisses à l’esprit visionnaire. Au cours des dix dernières années, l’institut s’est développé en une fédération de 22 groupes de recherche et de services et fédère quelque 250 scientifiques, tous affiliés simultanément aux Universités et Ecoles Polytechniques Fédérales de Suisse. Les membres et collaborateurs de l’ISB se consacrent aussi bien à la recherche de pointe dans le domaine de la bioinformatique qu’à des activités d’enseignement et de service. Ils participent aux divers programmes de Bachelors et Masters proposés par les institutions académiques de notre pays et offrent des services indispensables à la communauté scientifique suisse et internationale dans le domaine des sciences de la vie, mettant à sa disposition des outils informatiques et des bases de données, dont la base de données de protéines UniProtKB/Swiss-Prot aujourd’hui mondialement reconnue.
Pour commémorer son 10ème anniversaire, l’ISB organise un certain nombre d’activités qui se dérouleront tout au long de l’année et à travers tout le pays:
Berne
Une conférence scientifique du jubilé qui se tiendra au Kultur-Casino à Berne, le mercredi 24 septembre, constituera le point culminant de cette série d'événements.
Bâle
La première manifestation célébrant le 10ème anniversaire de l'ISB fut la conférence [BC]2 Basel Computational Biology Conference qui s'est déroulée à Bâle les 13 et 14 mars et qui avait pour thème Computational Structural Biology .
Genève
Du 1er au 30 septembre, l'exposition The Chromosome Walk , présentée au Jardin Botanique de Genève, invitera les visiteurs de tous âges à une promenade au cœur de l'univers infiniment petit des gènes et des protéines.
L'European BioAlpine Convention vous invite également à fêter le 10ème anniversaire de l'ISB. La manifestation se déroulera les 3 et 4 décembre à Genève et rassemblera les responsables des plus grandes sociétés pharmaceutiques et de biotechnologie, ainsi que des chercheurs des grandes institutions académiques nationales et internationales.
Lausanne
Dans le cadre de l'exposition photo SIB scientists unveiled , les scientifiques de l'Institut se dévoilent au travers de photos inédites et surprenantes qui les mettent en scène. L'exposition se tiendra du 28 mai au 30 juin dans le hall du bâtiment Génopode à l'Université de Lausanne.
Avant de visiter d’autres villes et pays, l'exposition The Chromosome Walk sera également présentée à Lausanne dans le courant de l'automne.
Zurich
Enfin, il ne faudra pas manquer l'exposition guidée montrant des images informatisées de structures de protéines intitulée Who is who in the cell: Proteins that make life happen . L'évènement se tiendra du 26 septembre au 17 octobre à l’ETH de Zurich.
ISB
L'Institut Suisse de Bioinformatique (ISB) est une fondation académique à but non-lucratif établie le 30 mars 1998. Ses missions sont la promotion de la recherche, le développement de bases de données et de logiciels, la formation et les activités de services dans le domaine de la bioinformatique. L'Institut produit entre autres des logiciels de pointe pour la recherche dans les sciences de la vie, ainsi que des bases de données minutieusement annotées, notamment UniProtKB/Swiss-Prot, la base de données de protéines la plus utilisée dans le monde. L'ISB comprend également des groupes de recherche de renommée mondiale dans les domaines de la protéomique, la génomique comparative, l'évolution moléculaire et la prédiction de la structure des protéines. Les groupes de l'ISB sont affiliés à ses institutions partenaires, telles que les Universités de Bâle, Genève, Lausanne et Zurich, ainsi que les deux Ecoles Polytechniques Fédérales. Pour de plus amples informations, veuillez consulter la page: http://www.isb-sib.ch
ExPASy
ExPASy a été créé en août 1993 et fut le premier site Web dans le domaine des sciences de la vie. Le serveur de protéomique de l'ISB est dédié à la biologie moléculaire et plus particulièrement aux données sur les protéines. La protéomique est l'étude à grande échelle des protéines, en particulier leurs structures et leurs fonctions. Le serveur donne accès à plusieurs bases de données, ainsi qu'à de nombreux documents essentiels pour les chercheurs du domaine. Il met également à disposition de nombreux outils d'analyse pour l'identification des protéines, l'analyse de leurs séquences ainsi que la modélisation de leur structure tridimensionnelle. Pour de plus amples informations, veuillez consulter la page: http://www.expasy.org/
SWISS-MODEL
SWISS-MODEL est un serveur entièrement automatisé pour la modélisation de structures de protéines par homologie. SWISS-MODEL fut créé en 1993 chez Glaxo Wellcome Experimental Research à Genève en collaboration avec l'ISB. Depuis 2001, SWISS-MODEL est développé et maintenu par le groupe «Protein Structure Bioinformatics» à l'ISB et au Biozentrum de l'Université de Bâle. Pour de plus amples informations, veuillez consulter la page: http://swissmodel.expasy.org/SWISS-MODEL.html
SWISS-2D PAGE
SWISS-2DPAGE est une base de données d'images annotées de gels d'électrophorèse mono- et bidimensionnelle. Elle a été établie en 1993 et est maintenue grâce à une collaboration entre le groupe de Recherche en Protéomique Biomédicale de l'Université de Genève et le groupe d'Informatique Protéomique de l'ISB. Chaque entrée de SWISS-2DPAGE contient des informations sur une protéine, incluant la méthode d'identification, des informations physiopathologiques, des données expérimentales, des références bibliographiques, ainsi que des images de gels d'électrophorèse indiquant la position où la protéine a été trouvée expérimentalement. Pour de plus amples informations, veuillez consulter la page: http://www.expasy.org/ch2d/
PROSITE
PROSITE est une banque de données de familles et de domaines de protéines. Elle est basée sur l'observation que malgré le nombre important de protéines différentes, une grande partie de celles-ci peuvent être classées en un nombre restreint de familles sur la base des similarités de séquences. Les protéines ou les domaines protéiques appartenant à une famille donnée sont dérivés d'un ancêtre commun et partagent généralement des propriétés fonctionnelles. En étudiant les séquences de familles de protéines, il apparaît que certaines régions ont été mieux conservées que d'autres au cours de l'évolution. Ces régions les mieux conservées sont généralement importantes pour la fonction de la protéine et/ou pour préserver sa structure tridimensionnelle. PROSITE contient actuellement des motifs et des profiles correspondant à plus de mille familles ou domaines. Pour de plus amples informations, veuillez consulter la page: http://www.expasy.org/prosite/
Melanie
Melanie est développé depuis 25 ans par le groupe d'Informatique Proteomique de l'ISB et est aujourd'hui l’un des logiciels les plus utilisés pour l'analyse de gels d'électrophorèse bidimensionnelle (2-DE). La version actuelle de Melanie offre des fonctionnalités puissantes pour l'extraction de différences d'expression entre échantillons protéomiques. Reconnu comme un des leaders mondiaux du marché, Melanie est distribué conjointement par GE Healthcare sous le nom d'ImageMaster 2D Platinum et par GeneBio sous son nom historique Melanie. Pour de plus amples informations, veuillez consulter la page: http://www.expasy.org/melanie/
Contacts :
Prof. Ron D. Appel, Directeur ISB
Tél: ++41 21 692 405
Dr Beatrice Bressan, Chargée de Communication
Tél: ++41 21 692 4054
2008