Pratiques en laboratoire de chimie et biologie

Objectifs

• Acquérir les concepts théoriques de base du système CRISPR/Cas9
• Acquérir les notions théoriques et pratiques des techniques de clonage
• Être capable d’analyser et interpréter des résultats de clonage et de transfection avec le système CRISPR/Cas9

Contenu

• Explication du système CRISPR/Cas9
• Types de vecteurs et leurs applications
• Techniques de clonage
• Design des séquences d'ARN guide pour le clonage appliqué à CRISPR/Cas9
• Design de clonage moléculaire par assemblage Gibson à partir d'un plasmide contenant la séquence Cas9
• Clonage moléculaire d'un plasmide d'ARN guide : insertion de la séquence guide d'intérêt par assemblage Gibson
• Transformation bactérienne E.coli
• Vérification des séquences par analyse des résultats de séquençage
• Amplification et purification des plasmides
• Analyse des séquences d'ADN obtenues à partir des cellules de mammifères transfectées avec le système CRISPR/Cas9

Méthodes

• Exposés théoriques, exercices, travaux dirigés
• Travaux pratiques individuels en laboratoire sur des instruments et des logiciels dédiés au clonage et au design d'ARN guides : 8 participant-es maximum

Pré-requis

• Connaissances théoriques de base sur la structure de l’ADN
• Connaissances pratiques de base de laboratoire et de biologie moléculaire conseillées

Planning

• 4 jours : 24 h de pratique + 8 h de théorie appliquée à la pratique

Prix 

• 1'500 CHF (sans ECTS)
• 1'750 CHF (avec ECTS) 

Objectifs

• Acquérir les bases théoriques des enzymes et leurs réactions
• Connaître les types d’inhibition enzymatique
• Comprendre les différentes étapes pratiques nécessaires au déroulement d’une réaction enzymatique
• Identifier les méthodes adéquates pour le suivi d’une réaction enzymatique
• Analyser et interpréter des données obtenues lors d’un suivi de réaction enzymatique

Contenu

• Enzymes
• Réactions enzymatiques
• Cinétique enzymatique de Michaelis-Menten
• Types d’inhibition enzymatique
• Détermination des paramètres de cinétique enzymatique par spectrophotométrie
• Détermination pratique du type d’inhibition des différents inhibiteurs
• Détermination de la puissance d’un inhibiteur enzymatique par HPLC: IC50

Méthodes

• Exposés théoriques en présentiel et à distance, exercices, travaux dirigés
• Travaux pratiques individuels en laboratoire sur des instruments : 8 participant-es maximum

Pré-requis

• Connaissances théoriques de base sur la structure des protéines et des petites molécules
• Connaissances pratiques de base de laboratoire conseillées

Planning

• 2 jours en présentiel et 1 journée à distance : 16 h de pratique en présence + 8 h de théorie appliquée à la pratique à distance

Prix 

• 1'500 CHF (sans ECTS)
• 1'650 CHF (avec ECTS) 

Objectifs

• Comprendre les étapes clés en culture cellulaire
• Mettre en culture des cellules eucaryotes
• Appliquer ces méthodes en laboratoire
• Analyser et interpréter 

Contenu

• Préparation de milieux et des surfaces de culture (coating)
• Décongélation et congélation des cellules
• Passage et amplification
• Comptage manuel et automatique
• Ensemencement sur différents supports
• Application d’utilisation de ces cellules: transfection CRISPR-Cas9, génération de sphéroïdes (3D), essai cellulaire et test de viabilité
• Analyse et interprétation des données cellulaires

Méthodes

• Exposés théoriques en présentiel
• Travaux pratiques individuels en laboratoire : 6 participant-es maximum

Pré-requis

• Connaissances pratiques de base de laboratoire conseillées

Planning

• 3 jours : 2 h / jour de théorie appliquée à la pratique et 6 h / jour de pratique

Prix 

• 1'700 CHF (sans ECTS)
• 1'850 CHF (avec ECTS) 

Objectifs

• Mettre en pratique des techniques de bases d’analyse des protéines
• Pouvoir mettre en évidence une protéine à partir de cellules de mammifères grâce à des méthodes de biologie

Contenu

• Extraction de protéines à partir d’un culot cellulaire
• Quantification des protéines par méthode colorimétrique
• Séparation et visualisation des protéines sur gel de polyacrylamide
• Visualisation d’une protéine spécifique par western-blot
• Analyse et interprétation des résultats

Méthodes

• Exposés théoriques, exercices, travaux dirigés
• Travaux pratiques individuels en laboratoire sur des instruments : 8 participant-es maximum

Pré-requis

• Connaissances théoriques de base sur la structure des protéines
• Connaissances pratiques de base de laboratoire conseillées

Planning

• 3 jours : 20 h de pratique + 4 h de théorie appliquée à la pratique

Prix 

• 1'500 CHF (sans ECTS)
• 1'650 CHF (avec ECTS) 

Objectifs

• Connaître les principes de chromatographie en phase liquide
• Comprendre les conditions nécessaires au bon déroulement des analyses HPLC
• Se familiariser avec les détecteurs UV en couplage à l’HPLC
• Savoir préparer des solutions pour une gamme d’étalonnage et pour des échantillons à doser
• Savoir réaliser des analyses à partir d’une méthode chromatographique déjà développée
• Identifier les méthodes possibles pour les dosages HPLC/UV
• Analyser et interpréter des données chromatographiques pour le calcul de dose

Contenu

• Introduction à l’HPLC
• Notions pratiques de phase mobile et de phase stationnaire : éluants et colonnes
• Domaines d’application pratique de l’HPLC
• Introduction aux différentes méthodes d’étalonnage et leurs implications pratiques
• Préparation des standards de calibration et des échantillons à doser
• Dosage d’une substance UV-active au sein d’un mélange par HPLC/UV à l’aide d’un étalonnage externe ou d'un étalonnage interne ou d'ajouts dosés
• Analyse des données expérimentales pour le calcul de la concentration des substances analysées dans un mélange inconnu

Méthodes

• Exposés théoriques en présentiel et à distance, exercices, travaux dirigés
• Travaux pratiques individuels en laboratoire sur des instruments : 8 participant-es maximum

Pré-requis

• Connaissances théoriques de base sur la structure chimique de petites molécules.
• Connaissances théoriques de base en utilisation d’Excel

Planning

• 2 jours en présentiel et 1 journée à distance : 16 h de pratique en présence + 8 h de théorie appliquée à la pratique à distance

Prix 

• 1'500 CHF (sans ECTS)
• 1'800 CHF (avec ECTS)