Le laboratoire MicroAdapt étudie la dynamique microbienne, l'adaptation et la biogéographie dans le cadre du changement global. Bien que notre recherche se concentre principalement sur les écosystèmes polaires et alpins, nous nous engageons à étudier les communautés microbiennes dans un large éventail d'environnements, des systèmes à faible biomasse aux zones plus tempérées. Notre approche multidisciplinaire allie des études sur le terrain, des expériences en laboratoire, des techniques multi-omiques et la modélisation informatique afin de comprendre les facteurs qui influencent la composition des communautés microbiennes et leurs réponses aux changements environnementaux.
Un thème central de nos recherches est de découvrir les processus dynamiques qui régissent la structure et la distribution des communautés microbiennes à l’échelle mondiale. Nous étudions comment les changements environnementaux influencent la régulation des gènes microbiens, comment ces ajustements impactent la composition des communautés, et comment les dynamiques microbiennes évoluent en réponse aux changements environnementaux rapides. En élucidant les mécanismes moléculaires qui permettent aux micro-organismes de prospérer dans des conditions extrêmes, nous visons à prédire l’évolution du fonctionnement des écosystèmes à mesure que le changement climatique s’intensifie.
Nos recherches actuelles se concentrent sur plusieurs projets clés, explorant la biogéographie et la distribution des micro-organismes, la différenciation des niches écologiques, ainsi que les invasions microbiennes. En étudiant la répartition spatiale et temporelle des microbes à travers divers écosystèmes, nous visons à identifier les facteurs qui influencent la structure des communautés microbiennes, à comprendre comment ces dernières s’adaptent à des niches écologiques spécifiques, et à analyser l'impact du changement climatique sur la résilience et la stabilité de ces communautés, en particulier dans les environnements fragiles.
Thèmes et projets de recherche clés :
Biogéographie microbienne : nous examinons les schémas spatiaux des communautés microbiennes afin de comprendre comment des facteurs tels que les propriétés du sol, le climat et la géographie influencent la diversité et la distribution des microorganismes. Nous utilisons des techniques de modélisation spatiale pour cartographier les schémas biogéographiques des communautés microbiennes du sol et prévoir comment ces schémas peuvent évoluer en réponse aux changements environnementaux futurs.
Niches microbiennes : nos recherches explorent la manière dont les micro-organismes occupent des niches écologiques distinctes le long des gradients environnementaux. Grâce à l'utilisation de techniques multi-omiques de pointe telles que la métagénomique et la métatranscriptomique, nous définissons les niches métaboliques des micro-organismes, ce qui nous permet de mieux comprendre leur rôle écologique et leur capacité d'adaptation à des conditions environnementales extrêmes.
Invasions et colonisations microbiennes : nous étudions la dispersion et la colonisation des micro-organismes à travers les frontières des écosystèmes, notamment dans la neige, le sol et l'air. Nos projets étudient le mouvement des microbes des environnements aériens vers le sol et d'autres habitats, ainsi que les réactions des communautés microbiennes et des écosystèmes face à ces événements de colonisation. Ces travaux sont essentiels pour comprendre l'impact des invasions microbiennes dans un contexte de changement climatique rapide.
À travers ces projets, le laboratoire MicroAdapt cherche à approfondir sa compréhension des mécanismes d’adaptation des communautés microbiennes aux changements environnementaux mondiaux et à fournir des informations cruciales sur la résilience de la vie dans les écosystèmes extrêmes.