Thomas Agoritsas obtient un diplôme de médecin à Genève en 2006. Il se spécialise ensuite en médecine interne (titre de spécialiste en 2011), et obtient la même année un doctorat en médecine. En parallèle à sa formation clinique, il développe ses  compétences de recherche à l’Université de Rotterdam et mène des projets de recherche au sein des services de qualité des soins et d’épidémiologie clinique des HUG. En 2012, il part compléter sa formation et séjourne pendant quatre ans à l’Université de McMaster au Canada, où il obtient un PhD en méthodologie de recherche clinique. De retour aux HUG, il est d’abord chef de clinique scientifique, puis médecin adjoint au service de médecine interne générale. Sa ligne de recherche est centrée sur la mise en oeuvre et l’individualisation de l’Evidence-Based Medicine en pratique clinique, des méthodes de développement des lignes directrices jusqu’à l’interaction avec les patient-es dans la décision médicale partagée. Privat-docent de la Faculté de médecine en 2018, Il est nommé professeur assistant au Département de médecine en novembre 2019.