Technologies/Réactifs

Logiciels UNIGE, HUG, HES-SO et Technologies Open Hardware

Cette page présente une liste non exhaustive des logiciels produits par les chercheurs d'UNIGE, des HUG et de la HES-SO ainsi que des technologies Open Hardware et Open Source disponibles. Des licences non-exclusives sont disponibles sur demande ou en acceptant les conditions des licences open-hardware ou open-source.

EDENA: Assembleur pour reads très courts (Ref. 545-A364)

Bénéfices

Ce logiciel issu du laboratoire de recherche en génomique de l'Hôpital Cantonal Universitaire de Genève est un assembleur pour le séquençage d'ADN à haut-débit. Edena se démarque de ses concurrents car il représente les données à assembler par un «graphe des recouvrements». Cette représentation permet une meilleure exploitation des données ainsi qu'une utilisation simplifiée. Le programme permet de produire des génomes bactériens complets d'une très haute fiabilité.

Licences

Ce logiciel est gratuit pour la recherche académique, mais requière une licence d'exploitation formelle pour une utilisation commerciale. Edena peut être téléchargé à l'adresse suivante:conditions.

Références

L'article de référence est: Hernandez D, François P, Farinelli L, Osterås M, Schrenzel J. De novo bacterial genome sequencing: millions of very short reads assembled on a desktop computer,Genome Research. 18:802-809, 2008.

Easy-Phi: plateforme d'instrumentation scientifique

Bénéfices

Easy-Phi est une nouvelle plateforme de distribution de modules électroniques pour l'expérimentation dans le domaine de l'optique quantique. Les modules Easy-Phi sont aussi adaptés pour d'autres applications en physique et en biologie. Ils sont particulièrement utiles pour les mesures corrélées temporellement où une électronique à haute vitesse est requise. Les modules sont distribués au moyen de licence open-hardware et open-software.

Licences

Les informations complémentaires sur les licences Easy-Phi sont disponibles sur le site web suivant:www.easy-phi.ch