Anne Baroffio effectue ses études à Lausanne, où elle obtient un Doctorat en biologie en 1985. Un stage post-doctoral de 3 ans à l’institut d’embryologie du CNRS de Nogent-sur-Marne l’amène à travailler sur les cellules souches précurseuses du système nerveux périphérique. En 1988, elle arrive à la Faculté de médecine de l’UNIGE en tant que maître-assistante, où elle poursuit ses recherches sur les cellules souche du muscle squelettique.

La création en 1994 de l’Unité de développement et de recherche en éducation médicale (UDREM) l’amène progressivement à modifier sa trajectoire, en participant à la réforme de l’enseignement de la médecine. Nommée chargée d’enseignement, puis maître d’enseignement et de recherche en 2009, elle est promue à la fonction de professeure associée en 2016. Anne Baroffio a assumé diverses missions au sein de l’UDREM, dont la direction du programme de formation pédagogique des enseignant-es et celle du CAS de Formateur/trice en sciences de la santé. Elle a mené plusieurs projets de recherche dont un suivi des étudiant-es en médecine tout au long de leur cursus. Très investie dans les instances facultaires, elle a siégé dans diverses commissions dont celle de l’enseignement et a été présidente du Conseil participatif. Elle a également contribué aux projets de coopération internationale de la Faculté de médecine dans le domaine de l’enseignement de la médecine et le développement de curricula, au Kirghizstan notamment. Elle prend sa retraite en septembre 2021.