Jacques Schrenzel obtient un diplôme de médecin en 1989 à l’UNIGE. Il se spécialise ensuite en médecine interne et en maladies infectieuses. De 1997 à 2000, il effectue un séjour post-doctoral à la Mayo Clinic de Rochester, aux Etats-Unis, où il axe ses recherches sur la microbiologie moléculaire et la génomique bactérienne. À son retour à Genève, il obtient une bourse professorale du FNS et crée un laboratoire travaillant notamment sur les profils génomiques de virulence et de persistance du Staphylococcus aureus.

Pionnier de l'analyse génomique des agents pathogènes, Jacques Schrenzel dirige le laboratoire de recherche génomique des HUG depuis 2000, ainsi que, depuis 2004, le laboratoire de bactériologie et le centre national de référence sur les méningocoques (www.meningo.ch). Son laboratoire de recherche en génomique (www.genomic.ch) participe activement au développement de méthodes en métagénomique et à leur application à la recherche médicale et au diagnostic. Il préside le Comité suisse d'experts pour la biosécurité et la Société suisse de microbiologie. Il est membre des groupes d'étude européens sur le diagnostic moléculaire et sur le microbiote. Fondateur de la Société internationale de métagénomique clinique et organisateur du Congrès international annuel de métagénomique clinique, il est également engagé dans l'enseignement aux étudiant-es de la Faculté de médecine et consultant en maladies infectieuses aux HUG. Professeur associé depuis 2009, il est nommé professeur ordinaire au Département de médecine de la Faculté de médecine de l’UNIGE en décembre 2022.