Formats de fichiers

Le choix d'un format de fichier approprié est crucial. Que ce soit pendant ou après la recherche, il assure que les données soient accessibles, interopérables et réutilisables, en accord avec les principes FAIR.
On distingue :

  • Les formats ouverts sont caractérisés par leurs spécifications publiquement disponibles. Ils peuvent ainsi être lus, utilisés et, selon les cas, modifiés sans dépendre exclusivement d’une application ou d’un fournisseur particulier. Ils facilitent l’accès aux données sur le long terme, limitent les risques liés à l’obsolescence des logiciels et offrent généralement de meilleures garanties de pérennité.
  • Les formats propriétaires, ou fermés, sont contrôlés par un éditeur ou un fournisseur spécifique. Ils sont souvent associés à un logiciel, un instrument ou un environnement technique particulier. Les données brutes produites par certains équipements, par exemple des scanners, appareils photo, enregistreurs ou logiciels spécialisés, peuvent être générées dans ce type de format. Lorsque le logiciel ou l’environnement nécessaire à leur lecture n’est plus disponible, l’exploitation de ces fichiers peut devenir difficile, voire impossible. 

Il est donc recommandé d'enregistrer vos données dans un format ouvert lorsque cela est possible. 

Recommandations

Le tableau suivant liste les formats recommandés et les formats acceptables pour divers types de données. Attention, la liste n’est pas exhaustive et ne mentionne que les formats les plus courants.

Type de données Formats recommandés Formats acceptables Formats non recommandés

Données sous forme de tableaux, avec des métadonnées détaillées 

Variables et code définis, valeurs manquantes clairement définies

 .POR;
.DDI;
.XML
.CSV
.HDF5
delimited text and command ('setup') file (SPSS, Stata, SAS, etc.)		 .TXT
.HTML
.TEX
.FASTQ
.POR
. SAV
.DTA
.MDB/.ACCDB

Données sous forme de tableaux, avec peu de métadonnées

Intitulés de colonnes, noms de variables

 .CSV 
.TAB 
.ODS
.SQL
.TSV

.TXT
.MDB / ACCDB 
.DBF 
.ODS 
.XML

 .XLS / .XLSB

Données géospatiales

Données vectorielles et matricielles

 .SHP
.SHX
.DBF
.PRI
.SBX
.SBN
.TIF
.TFW
.DGW 
Tabular GIS attribute data
.GML 
.NETCDF
.POSTGIS
.GEOJSON		 .MDB
.MIF 
.KML 
.AI
.DXF 
.SVG
binary formats of GIS and CAD packages		  
Documents et scripts .RTF
.PDF
.PDF/A
.PDF/UA
.XHTML 
.HTML
.ODT

.TXT
.DOC/DOCX
.XLS/.XLSX
.XML 

Données textuelles

 .TXT
.XML
.PDF/A
.ODT
.ODM
.TEX
.MD
.HTM
.EXTXYZ
.ODF		 .HTML
.DOCX
.PPTX
.RTF - Rich Text Format
.PDF
.EPS
.IPF
some software-specific formats: NUD*IST, NVivo, ATLAS.ti		 .DOC
.PPT
.DVI
.PS
Images .TIF (6.0 uncompressed)
.PNG
.SVG
.JPEG
.FITS		 .JPG
.JP2
.GIF 
.TIF
.TIFF 
.RAW
.PSD
.BMP
.PDF
.JCAMP
.DM3
.OIR
.LSM
.MP3 
.AIF		 .INDD
.AIT
.PSD
.SPC
.LIF
Audio .WAV
.FLAC 
.OGG
.MXL
.MIDI
.MEI
.KRN

.MP3
.AIF
Video .MP4
.MJ2
.AVI
.MKV		 .AVCHD
.WEBEM
.OGV
.OGG		 .WMV
.MOV
.QT
Structures et images 3D .X3D
.X3DV
.X3DB
.PDF3D
.POV
.PDBML		 .DWG
.DXF
.PDB		 .PXP
Code .M
.R
.PY
.IJPNB
.RSTUDIO
.RMD
.NETCDF
.AIML
.JSON		 .SDD

.MAT
.RDATA

(Source  : UK Data Service et EPFL FastGuide #4 - File Formats)

Outils de conversion

Il existe différents moyens de convertir un fichier pour le faire passer d’un format à un autre, par exemple d'un format propriétaire vers un format ouvert.

Convertisseurs gratuits et pouvant être installés en local:

⚠️(Ces outils sont particulièrement recommandés si la conversion porte sur des documents contenant des données personnelles ou sensibles non anonymisées.)

  • Pandoc : local, reconnaît des centaines de formats ;

  • Audacity : local, pour les fichiers audio ;

  • Videolan : local, pour les fichiers audio et vidéo ;

  • HandBrake : local, pour les fichiers vidéo.

Convertisseurs gratuits  en ligne, nécessitant de transférer les fichiers:

⚠️(Ces outils sont à proscrire absolument dans le cas de documents contenant des données personnelles ou sensibles non anonymisées.)

  • TinyWow: convertisseur en ligne, pour les fichiers Excel, CSV, XML et JSON ;

  • FileConverter : convertisseur en ligne pour les fichier audio, documents, images, vidéos ;

  • MiConv : convertit les fichiers en ligne, prend en charge plus de 250 formats couvrant tous les types de fichiers principaux.

Lorsque la conversion engendre une altération de la forme du document, il vaut la peine de conserver, par sécurité, les données dans les deux formats.

Outils de compression

Un volume important de données peut entraîner des frais de stockage et d’archivage élevés. La compression peut permettre de réduire la taille des fichiers ou de regrouper plusieurs fichiers dans une archive.

Deux types de compression existent :

  • la compression sans perte, qui réduit la taille des fichiers sans supprimer d’information ;
  • la compression avec perte, qui réduit davantage la taille des fichiers, mais en supprimant certaines informations.

Exemples d'outils:

•    7-Zip: gratuit, taux de compression élevé;
•    Keka: gratuit, pour macOS, à télécharger via le Mac App Store;
•    FileConverter: convertisseur en ligne.

Windows et macOS permettent également de compresser des fichiers sans installer de logiciel tiers, notamment via le menu contextuel accessible par clic droit.

Pour aller plus loin

Ressources UNIGE

Préparer ses données en vue de l'archivage

Formations UNIGE

Autres ressources

Trouver d'autres formats

 

Dernière mise à jour: 17 juillet 2026