Le partage des données de recherche comporte deux aspects : la mise à disposition des données et la réutilisation des données. La mise à disposition de vos données pour d’autres chercheurs et chercheuses augmente la visibilité de vos activités de recherche, et peut conduire à l’éclosion de nouvelles collaborations. La réutilisation de données permet l’économie des ressources qui auraient été nécessaires à leur production.
Il est important de considérer de la même manière le partage de données qui n’ont pas vocation à être rendues publiques (par exemple : dans le cadre de la réutilisation des données au sein du laboratoire, ou le cas des données chaudes d’un projet collaboratif). Il est également important de conserver sa souveraineté sur ses données de recherche, et d’envisager de ne les partager qu'au sein d’environnements sécurisés.
Il existe plusieurs solutions pour échanger des données de recherche sous la forme d’espaces de travail collaboratifs. Ces espaces de travail sont souvent spécifiques à certains types de données ou à certaines disciplines. Le tableau ci-dessous fournit une liste d’espaces de travail collaboratifs recommandés pour les activités de recherche de la Faculté.
Le document inventaire des espaces de travail collaboratifs @FacMed, disponible au téléchargement, complète le tableau en fournissant une description détaillée des espaces recommandés, avec une information sur la souveraineté des données ainsi que le lieu / pays où les données sont stockées. De plus, pour certaines entrées, les noms d'une personne de contact et / ou d'un-e Super-User UNIGE sont donnés.
| Disciplines | Platform name | Data types | Keywords |
|---|---|---|---|
| general | Open Science Framework (OSF) | all | collaborative research ; open science ; multi-project management |
| general | Open Microscopy Environment (OMERO) | microscopy images | microscopy data ; image management ; bioimaging |
| neurosciences | EBRAINS | neuroscience data ; federated infrastructure ; brain research | |
| radiology | Kheops (LAVIM) | radiological images | medical imaging ; radiology archives ; clinical data |
| non-specific | Federated European Genome-phenome Archive (FEGA) | genomic data | controlled access ; human genomics ; sensitive data |
| non-specific | Shanoir | medical imaging data | medical imaging ; data federation ; ontology-based organization |
| non-specific | BioMedIT | sensitive data | secure infrastructure ; sensitive research data ; gdpr compliance |
| non-specific | NCBI / DDBJ BioProject | omics | omics projects ; project-level aggregation ; sequence data |
| non-specific | BioStudies | all | study metadata ; dataset aggregation ; ebi resources |
| non-specific | Yareta | all | institutional repository ; open data ; long-term archiving |
| non-specific | hedera | RDF | linked data ; digital humanities ; semantic web |
| non-specific | SmartLab-eLabNext | ELN/LIMS ; data documentation ; collaborative tool |
Conception : Valérie Barbié, Philippe Bijlenga, Johann Bosson, Hugues Cazeaux, Sébastien Courvoisier, Arnaud Didierlaurent, Timothy Frayling, Aurélie Kamoun, Floriane Muller, Douglas Teodoro
Mise à jour : 24.04.2026
