Partage des données
Le partage des données de recherche comporte deux aspects : la mise à disposition des données et la réutilisation des données. La mise à disposition de vos données pour d’autres chercheurs et chercheuses augmente la visibilité de vos activités de recherche, et peut conduire à l’éclosion de nouvelles collaborations. La réutilisation de données permet l’économie des ressources qui auraient été nécessaires à leur production.
Le partage des données de recherche nécessite, entre autres, la FAIRification des données (par exemple : utilisation d’ontologies et de standards reconnus, utilisation d’identifiants pérennes (PID)), une documentation détaillée et des métadonnées enrichies.
Il est important de considérer de la même manière le partage de données qui n’ont pas vocation à être rendues publiques (par exemple : dans le cadre de la réutilisation des données au sein du laboratoire, ou le cas des données chaudes d’un projet collaboratif).
Il est également important de conserver sa souveraineté sur ses données de recherche, et d’envisager de ne les partager seulement au sein d’environnements sécurisés. Il existe des espaces de travail collaboratifs spécifiques de certains des types de données couramment rencontrés en Faculté de médecine.
FAIRification des données de recherche
La FAIRification des données en vue de leur partage requiert, entre autres, l’utilisation généralisée de standards reconnus et d’identifiants pérennes.
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Standards
L’inventaire des standards disciplinaires @FacMed est classé par discipline et ne contient que des standards reconnus et largement utilisés. Pour chaque entrée, une description du standard est donnée ainsi que sa date de création, et un lien fairsharing.org est fourni pour de plus amples informations.
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Identifiants pérennes (PID)
L’inventaire PID @FacMed contient une liste d’identifiants pérennes couvrant des domaines d’application très larges (identifiants de personnes, de littérature, de code), ainsi que des domaines spécifiques aux sciences médicales (identifiants de protéines, gènes, lipides, anticorps, etc…).
Où partager ses données de recherche ?
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Au cours de la recherche
Il existe plusieurs solutions pour échanger des données de recherche sous la forme d’espaces de travail collaboratifs. Ces espaces de travail sont souvent spécifiques à certains types de données ou à certaines disciplines. L’inventaire des espaces de travail collaboratifs @FacMed fournit une description des espaces recommandés pour les activités de recherche de la Faculté, avec une information sur la souveraineté des données et une indication sur les personnes de contact si besoin.
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A la fin de la recherche
La page ResearchData@UNIGE recense les dépôts généralistes couramment utilisés, tels que Yareta, Zenodo ou OSF.
L’utilisation de Data repositories disciplinaires est fortement recommandée pour certains types de données (par exemple données génétiques). Cela participe de manière générale à l’augmentation de la visibilité de vos données et donc de vos activités de recherche. L’inventaire des data repositories disciplinaires @FacMed compile les repositories d’intérêt pour la Faculté de médecine.
Vous pouvez utiliser cet inventaire pour identifier le repository le plus adapté à la diffusion de vos données de recherche. Vous pouvez également l’utiliser pour explorer les données dans votre domaine, et identifier des jeux de données prêts à être réutilisés dans vos activités de recherche.
Dans cet inventaire, les repositories sont classés par discipline. Des informations supplémentaires sur chaque dépôt sont disponibles via les liens associés fairsharing.org ou re3data.org. De plus, vous pouvez vérifier rapidement si les dépôts sont recommandés par le FNS ou par tout autre organisme de financement ou société éditrice de revue scientifique.
Par ailleurs, les National Institutes of Health (NIH) mettent à disposition le NIH-Supported Data Sharing Resources qui est un inventaire des repositories supportés par les NIH. De son côté, le FNS fournit une liste de data repositories couramment utilisés par la communauté de recherche suisse et qui répondent aux critères ORD du FNS.
Groupe de travail Partage :
Valérie Barbié, Camilla Bellone, Eric Beuchotte, Philippe Bijlenga, Laurent Bouysset, Hugues Cazeaux, Sébastien Courvoisier, Arnaud Didierlaurent, Timothy Frayling, Aurélie Kamoun, Floriane Muller, Douglas Teodoro